RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641582.1

CASC19-241, Transcript of cancer susceptibility 19, humanhuman

Gene CASC19, Length 1,421 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC19-241ENST00000641582 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 RTL8AQ9BWD3 113 aa3.36□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 TMEM59Q9BXS4 323 aa3.36□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 ATG5Q9H1Y0 275 aa3.36□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 ZNF442Q9H7R0 627 aa3.36□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP3.36□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 ABCB10Q9NRK6 738 aa3.36□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 GPR173Q9NS66 373 aa3.36□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 TMEM100Q9NV29 134 aa3.36□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa3.36□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 ING4Q9UNL4 249 aa3.36□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa3.36□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa3.36□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 NCOR2Q9Y618 2525 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 NINQ8N4C6 2090 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 TRAV18A0A075B6X5 111 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 A0A0J9YWU9 116 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 A0A1W2PN81 502 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 A0A1W2PQ09 198 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 A0A1W2PR80 420 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 LRP5LA4QPB2 252 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 A6NIN4 97 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 H7C417 338 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 J3QT63 122 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 LYRM1O43325 122 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 SSX4O60224 188 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 GOSR1O95249 250 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 MGMTP16455 207 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 TBPP20226 339 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 MPZP25189 248 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 CALCRP30988 508 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 FAUP35544 74 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 CHRNA7P36544 502 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 CFHR2P36980 270 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 OR3A4PP47883 348 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 PSG7Q13046 419 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 UNC119Q13432 240 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 RSU1Q15404 277 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 CDNFQ49AH0 187 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 OR2T2Q6IF00 324 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 OSR2Q8N2R0 312 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 CENPSQ8N2Z9 138 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 OR51T1Q8NGJ9 327 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 OR8S1Q8NH09 359 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 OR51F2Q8NH61 342 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 GPX8Q8TED1 209 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 AQP3Q92482 292 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 YIPF5Q969M3 257 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 GAL3ST1Q99999 423 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 OR2J1Q9GZK6 312 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 LPAR5Q9H1C0 372 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 CXXC4Q9H2H0 198 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 OR51I2Q9H344 312 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 AUNIPQ9H7T9 357 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 SPACA1Q9HBV2 294 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 KCNJ16Q9NPI9 418 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 COPZ2Q9P299 210 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 MTFP1Q9UDX5 166 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 CHD8Q9HCK8 2581 aa3.34□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa3.34□□□□□ -1.87
CASC19-241ENST00000641582 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa3.34□□□□□ -1.88
CASC19-241ENST00000641582 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa3.34□□□□□ -1.88
CASC19-241ENST00000641582 DPRXA6NFQ7 191 aa3.34□□□□□ -1.88
CASC19-241ENST00000641582 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
CASC19-241ENST00000641582 ZNF732B4DXR9 585 aa3.34□□□□□ -1.88
CASC19-241ENST00000641582 TRAPPC2LH3BP13 241 aa3.34□□□□□ -1.88
CASC19-241ENST00000641582 PLA2G10O15496 165 aa3.34□□□□□ -1.88
CASC19-241ENST00000641582 ORC5O43913 435 aa3.34□□□□□ -1.88
CASC19-241ENST00000641582 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
CASC19-241ENST00000641582 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
CASC19-241ENST00000641582 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
CASC19-241ENST00000641582 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
CASC19-241ENST00000641582 FUT3P21217 361 aa3.34□□□□□ -1.88
CASC19-241ENST00000641582 CA6P23280 308 aa3.34□□□□□ -1.88
CASC19-241ENST00000641582 RCVRNP35243 200 aa3.34□□□□□ -1.88
CASC19-241ENST00000641582 MPV17P39210 176 aa3.34□□□□□ -1.88
CASC19-241ENST00000641582 CD200P41217 278 aa3.34□□□□□ -1.88
CASC19-241ENST00000641582 HAAOP46952 286 aa3.34□□□□□ -1.88
CASC19-241ENST00000641582 FABP6P51161 128 aa3.34□□□□□ -1.88
CASC19-241ENST00000641582 ZNF83P51522 516 aa3.34□□□□□ -1.88
CASC19-241ENST00000641582 GPM6AP51674 278 aa3.34□□□□□ -1.88
CASC19-241ENST00000641582 EFNB2P52799 333 aa3.34□□□□□ -1.88
CASC19-241ENST00000641582 MFAP4P55083 255 aa3.34□□□□□ -1.88
CASC19-241ENST00000641582 RAG2P55895 527 aa3.34□□□□□ -1.88
CASC19-241ENST00000641582 TMEM50BP56557 158 aa3.34□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms