RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 COMMD1Q8N668 190 aa15.65■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 PRR7Q8TB68 274 aa15.65■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP15.65■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 LUZP4Q9P127 313 aa15.65■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 OR1A1Q9P1Q5 309 aa15.65■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa15.64■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 A0A1B0GU03 582 aa15.64■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 A6NLC8 198 aa15.64■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 ABCD4O14678 606 aa15.64■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 TNFSF12O43508 249 aa15.64■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 CD200P41217 278 aa15.64■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 NBL1P41271 181 aa15.64■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 ID3Q02535 119 aa15.64■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 BAXQ07812 192 aa15.64■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 SLC35E4Q6ICL7 350 aa15.64■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 BTNL8Q6UX41 500 aa15.64■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 OR14J1Q9UGF5 321 aa15.64■□□□□ 0.1
CLN8-211ENST00000636934 TM4SF5O14894 197 aa15.64■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 PITX3O75364 302 aa15.64■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 SPP1P10451 314 aa15.64■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP15.64■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 TESK1Q15569 626 aa15.64■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 Q6ZRG5 221 aa15.64■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 WFDC1Q9HC57 220 aa15.64■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 SLC25A15Q9Y619 301 aa15.64■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa15.63■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 F8W036 122 aa15.63■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 IFNL4K9M1U5 179 aa15.63■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 SSSCA1O60232 199 aa15.63■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 HEXAP06865 529 aa15.63■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 SMIM21Q3B7S5 101 aa15.63■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 C3orf36Q3SXR2 165 aa15.63■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 C10orf91Q5T1B1 145 aa15.63■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 C1orf185Q5T7R7 199 aa15.63■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 ACP7Q6ZNF0 438 aa15.63■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 C11orf53Q8IXP5 236 aa15.63■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 ZBTB34Q8NCN2 500 aa15.63■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 UQCC1Q9NVA1 299 aa15.63■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 A0A1B0GWJ7 208 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 OOEPA6NGQ2 149 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 DANCRP0C864 163 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 CEACAM6P40199 344 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 FABP6P51161 128 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 NHLH2Q02577 135 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 ZNF273Q14593 569 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 PRR18Q8N4B5 295 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 OR51H1Q8NH63 302 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 SEC11CQ9BY50 192 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 KCNS2Q9ULS6 477 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 FAM24AA6NFZ4 105 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 C3orf80F5H4A9 247 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 TSPAN4O14817 238 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 TIMM23BQ5SRD1 257 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 CLEC9AQ6UXN8 241 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 WDR82Q6UXN9 313 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 SEM1Q6ZVN7 128 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 LYPD6BQ8NI32 183 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 GALMQ96C23 342 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 GPHA2Q96T91 129 aa15.62■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 TRAV39A0A0B4J263 110 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 TRIM77I1YAP6 450 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 TSPAN15O95858 294 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 PSG2P11465 335 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 CAMLGP49069 296 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 AKR1C2P52895 323 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 AKR1C1Q04828 323 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 KRTCAP3Q53RY4 240 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 TMEM252Q8N6L7 170 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 RAB40CQ96S21 281 aa15.61■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 IGSF23A1L1A6 192 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 IL2RGP31785 369 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 TIMP3P35625 211 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 MSMO1Q15800 293 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 TRAT1Q6PIZ9 186 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 ATRAIDQ6UW56 229 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 Q6ZR03 302 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 OR10Z1Q8NGY1 313 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 GPR146Q96CH1 333 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 MAGT1Q9H0U3 335 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa15.6■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 KLK10O43240 276 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 SNAPINO95295 136 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 PRH1P02810 166 aa15.59■□□□□ 0.09
CLN8-211ENST00000636934 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms