RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	NRM	Q8IXM6	262 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RDH10	Q8IZV5	341 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	DOK4	Q8TEW6	326 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	HES7	Q9BYE0	225 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	PARL	Q9H300	379 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	DSN1	Q9H410	356 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM27	Q9HBJ8	222 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SSR3	Q9UNL2	185 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	MGA	Q8IWI9	3026 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	PNMA8C	A0A1B0GUJ8	204 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	C21orf140	B9A014	251 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616		F6UB75	175 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616		G3V3Y1	287 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC17A2	O00624	439 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RDH16	O75452	317 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNK2	O95069	426 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	GUSB	P08236	651 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ADRA2A	P08913	450 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TSPAN19	P0C672	248 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	GKN3P	P0CG01	181 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	LIPC	P11150	499 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TGFBR1	P36897	503 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RORC	P51449	518 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF136	P52737	540 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TAS2R60	P59551	318 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	PSG5	Q15238	335 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OR1Q1	Q15612	314 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SSX1	Q16384	188 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	IDNK	Q5T6J7	187 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	COX15	Q7KZN9	410 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF519	Q8TB69	540 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	NICN1	Q9BSH3	213 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	MRO	Q9BYG7	248 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	PLA2G12A	Q9BZM1	189 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	IFT46	Q9NQC8	304 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	PRTFDC1	Q9NRG1	225 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SDHAF2	Q9NX18	166 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CFL2	Q9Y281	166 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		3.89	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A0G2JRQ6	117 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ISPD	A4D126	451 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ICOSLG	O75144	302 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TNFSF15	O95150	251 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	VAMP5	O95183	116 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC2A10	O95528	541 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	GCG	P01275	180 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	THY1	P04216	161 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	IFNA16	P05015	189 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ARG1	P05089	322 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	IFI30	P13284	250 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	GNRHR	P30968	328 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	MAS1L	P35410	378 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	HCCS	P53701	268 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	WNT4	P56705	351 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	COPZ1	P61923	177 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF92	Q03936	586 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	PRKCD	Q05655	676 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ARL6IP1	Q15041	203 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	DEFB110	Q30KQ9	67 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL13AP3	Q6NVV1	102 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF613	Q6PF04	617 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	REG3G	Q6UW15	175 aa		3.88	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		3.88	□□□□□ -1.79

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