RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440		V9GYQ6	96 aa		4	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A0G2JPF8	293 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	CCS	O14618	274 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	TPST2	O60704	377 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	CA2	P00918	260 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	IL1A	P01583	271 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	HTR1F	P30939	366 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	DEFB131A	P59861	70 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	ST3GAL3	Q11203	375 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	LRIF1	Q5T3J3	769 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF613	Q6PF04	617 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM139	Q8IV31	216 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	PBK	Q96KB5	322 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	OR14A2	Q96R54	314 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	COPS4	Q9BT78	406 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPL46	Q9H2W6	279 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		3.99	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	SDHD	O14521	159 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	SPINT2	O43291	252 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	AHCYL1	O43865	530 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	NXPH4	O95158	308 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP5G1	P05496	136 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	GSTA1	P08263	222 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	GSTA2	P09210	222 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	TSPAN19	P0C672	248 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	CHTF8	P0CG12	524 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF3	P17036	446 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	GAL	P22466	123 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	VHL	P40337	213 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP5G3	P48201	142 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	FXYD3	Q14802	87 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF573	Q86YE8	665 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	NUAK2	Q9H093	628 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	SYT4	Q9H2B2	425 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	AASS	Q9UDR5	926 aa		3.98	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	MDN1	Q9NU22	5596 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM231B	A6NCW3	169 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	NOTO	A8MTQ0	251 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440		H7C1H1	209 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	SOX14	O95416	240 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	TDRG1	Q3Y452	100 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00311	Q8N616	119 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	RFESD	Q8TAC1	157 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	RXFP4	Q8TDU9	374 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	GHSR	Q92847	366 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	DESI2	Q9BSY9	194 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	HINT2	Q9BX68	163 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	XCL2	Q9UBD3	114 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	EXOSC1	Q9Y3B2	195 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		3.97	□□□□□ -1.77
SNAP23-223	ENST00000627440	TLDC2	A0PJX2	215 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	MARCH11	A6NNE9	402 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	SIRPB1	O00241	398 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC22A1	O15245	554 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	DFFB	O76075	338 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	CHEK2	O96017	543 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	MT-ND1	P03886	318 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	GSTT2	P0CG29	244 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	GSTT2B	P0CG30	244 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	DEFB130B	P0DP73	79 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	DEFB130A	P0DP74	79 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	UBE2K	P61086	200 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF91	Q05481	1191 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC36A3	Q495N2	470 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	MEST	Q5EB52	335 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		3.96	□□□□□ -1.78
SNAP23-223	ENST00000627440	MOB3C	Q70IA8	216 aa		3.96	□□□□□ -1.78

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