RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 ATP5SQ99766 215 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa17.92■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 SYNGR1O43759 233 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 NQO2P16083 231 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 COL10A1Q03692 680 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 FDX2Q6P4F2 183 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF826PQ6ZT77 177 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 RTP5Q14D33 572 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ZBTB34Q8NCN2 500 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 SHISA3A0PJX4 238 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 RPL31P62899 125 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 OR1K1Q8NGR3 316 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 CHAC2Q8WUX2 184 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ADAM11O75078 769 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 IGHMP01871 453 aa17.91■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 XKRY2A2RUG3 117 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 CHRDL1Q9BU40 450 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 DBX1A6NMT0 343 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF883P0CG24 379 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 HLA-GP17693 338 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM50BP56557 158 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM241Q24JQ0 296 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 C1orf174Q8IYL3 243 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 WNT5BQ9H1J7 359 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 NPTNQ9Y639 398 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A1W2PPE3 182 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF785A8K8V0 405 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 OR5I1Q13606 314 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNRF4Q8WWF5 429 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 RGS13O14921 159 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 SCTP09683 121 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 CD200P41217 278 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 UBE2V2Q15819 145 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 OR2V2Q96R30 315 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 SH2D2AQ9NP31 389 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 POMT1Q9Y6A1 747 aa17.9■□□□□ 0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A1B0GU03 582 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 ANGPTL6Q8NI99 470 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 THYN1Q9P016 225 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 CLN8Q9UBY8 286 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 CLDN14O95500 239 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 HARBI1Q96MB7 349 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 GPR132Q9UNW8 380 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 PPIAL4EA0A075B759 164 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 PPIAL4DF5H284 164 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 CLDN34H7C241 214 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 PPIAL4FP0DN26 164 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 SULT1A1P50225 295 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 AAMDCQ9H7C9 122 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 PPIAL4AQ9Y536 164 aa17.89■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 ORM2P19652 201 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 FDCSPQ8NFU4 85 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 PIPOXQ9P0Z9 390 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 LIPGQ9Y5X9 500 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 MGST3O14880 152 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 LPAR3Q9UBY5 353 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 INSIG2Q9Y5U4 225 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM255AQ5JRV8 349 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 C10orf128Q5T292 105 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 TIMP4Q99727 224 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 UBTD1Q9HAC8 227 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 CLCF1Q9UBD9 225 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 TNFSF18Q9UNG2 199 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 RBFOX3A6NFN3 312 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 K7ESF4 209 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 OR2H2O95918 312 aa17.88■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 M0QZ24 198 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM24BQ8N5W8 94 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 DHRS7CA6NNS2 312 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 OR4F17Q8NGA8 305 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 AQP3Q92482 292 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 CCL13Q99616 98 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 ITLN1Q8WWA0 313 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 SSMEM1Q8WWF3 244 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 KCNAB3O43448 404 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 CELA3AP09093 270 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 PAX5Q02548 391 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 IMMP1LQ96LU5 166 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 PRDM14Q9GZV8 571 aa17.87■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 ZNF250P15622 560 aa17.86■□□□□ 0.45
PTPRJ-208ENST00000615445 BLNKQ8WV28 456 aa17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms