RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613541.1

STX4-217, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-217ENST00000613541 TRAV39A0A0B4J263 110 aa13.23□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 OR4C45A6NMZ5 311 aa13.23□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 C15orf65H3BRN8 121 aa13.23□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 SPINT2O43291 252 aa13.23□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 HTR3BO95264 441 aa13.23□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 RAB3AP20336 220 aa13.23□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP13.23□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 STEAP3Q658P3 488 aa13.23□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 SATL1Q86VE3 508 aa13.23□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 STX19Q8N4C7 294 aa13.23□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP13.23□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 CST11Q9H112 138 aa13.23□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 DHDHQ9UQ10 334 aa13.23□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 ST3GAL6Q9Y274 331 aa13.23□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 G3V318 75 aa13.22□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 J3QLW9 94 aa13.22□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 DYNC1I1O14576 645 aa13.22□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 HLA-DRB1P01911 266 aa13.22□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 T-ENOLP0DO92 83 aa13.22□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa13.22□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 ZNF19P17023 458 aa13.22□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 MYF6P23409 242 aa13.22□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 PIGYQ3MUY2 71 aa13.22□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 NHLRC3Q5JS37 347 aa13.22□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 ASCL4Q6XD76 172 aa13.22□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 LYSTQ99698 3801 aa13.22□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 ZNF251Q9BRH9 671 aa13.22□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 JAM3Q9BX67 310 aa13.22□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 FAM192AQ9GZU8 254 aa13.22□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa13.22□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 METTL9Q9H1A3 318 aa13.22□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 PARP11Q9NR21 331 aa13.22□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 GNG12Q9UBI6 72 aa13.22□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 TNCP24821 2201 aa13.21□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 MAGEA13PA6NCF6 341 aa13.21□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 SNTNA6NMZ2 147 aa13.21□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 ATP6V0E1O15342 81 aa13.21□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 HSPA12AO43301 675 aa13.21□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 LANCL1O43813 399 aa13.21□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 SLURP1P55000 103 aa13.21□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 ACBD7Q8N6N7 88 aa13.21□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa13.21□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 MINDY2Q8NBR6 621 aa13.21□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 NEK7Q8TDX7 302 aa13.21□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 ARPC1AQ92747 370 aa13.21□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 PELI1Q96FA3 418 aa13.21□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 S100A13Q99584 98 aa13.21□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 TOLLIPQ9H0E2 274 aa13.21□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 C19orf73Q9NVV2 129 aa13.21□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 STUB1Q9UNE7 303 aa13.21□□□□□ -0.29
STX4-217ENST00000613541 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa13.2□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 TMEM212A6NML5 194 aa13.2□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 GABRPO00591 440 aa13.2□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 IGHV3-43DP0DP04 118 aa13.2□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 LSAMPQ13449 338 aa13.2□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 ATP6AP1Q15904 470 aa13.2□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 MPV17LQ2QL34 196 aa13.2□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 DNAL1Q4LDG9 190 aa13.2□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 C6orf183Q5T699 404 aa13.2□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 LPCAT4Q643R3 524 aa13.2□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 LIN54Q6MZP7 749 aa13.2□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 TRAT1Q6PIZ9 186 aa13.2□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 OR10K1Q8NGX5 313 aa13.2□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 OR52N1Q8NH53 320 aa13.2□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 OR5AK2Q8NH90 309 aa13.2□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 CCDC107Q8WV48 283 aa13.2□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 IL36GQ9NZH8 169 aa13.2□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 KIAA1456Q9P272 454 aa13.2□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 ING4Q9UNL4 249 aa13.2□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 AIPO00170 330 aa13.19□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 NBR2O15453 112 aa13.19□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 GYG2O15488 501 aa13.19□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 MT-ND4P03905 459 aa13.19□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 CD40LGP29965 261 aa13.19□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 VHLP40337 213 aa13.19□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 RBM11P57052 281 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 ACTBP60709 375 aa13.19□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 ATAD3CQ5T2N8 411 aa13.19□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 MEDAGQ5VYS4 303 aa13.19□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 PYHIN1Q6K0P9 492 aa13.19□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 ZNF497Q6ZNH5 498 aa13.19□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa13.19□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 ZNF439Q8NDP4 499 aa13.19□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 C4orf36Q96KX1 117 aa13.19□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 CIB1Q99828 191 aa13.19□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 SPACA1Q9HBV2 294 aa13.19□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 IMPAD1Q9NX62 359 aa13.19□□□□□ -0.3
STX4-217ENST00000613541 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms