RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 OR51I2Q9H344 312 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 CHODLQ9H9P2 273 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 MANBALQ9NQG1 85 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 TRANK1O15050 2925 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 A0A1W2PPC4 97 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 TMPRSS2O15393 492 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 NRASP01111 189 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 IGKV1D-33P01593 117 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 IGKV1-33P01594 117 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 G0S2P27469 103 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 LCN15Q6UWW0 184 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 OR2T10Q8NGZ9 312 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 OR5B12Q96R08 314 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 PARLQ9H300 379 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 FUT9Q9Y231 359 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 REV3LO60673 3130 aa8.45□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 MBP02144 154 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 CTXN2P0C2S0 81 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 F2RP25116 425 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 SELENOTP62341 195 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 CFHR1Q03591 330 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 C1orf189Q5VU69 101 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 PCSK4Q6UW60 755 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 BTF3L4Q96K17 158 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 LILRA1O75019 489 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 TNFSF13O75888 250 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 IGKV1-39P01597 117 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 IGKV1D-39P04432 117 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 OR3A1P47881 315 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 PRSS8Q16651 343 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 TMEM249Q2WGJ8 235 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 C17orf78Q8N4C9 275 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 ZIC4Q8N9L1 334 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 OR2AE1Q8NHA4 323 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 SCGB1C1Q8TD33 95 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 KLRF1Q9NZS2 232 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 MMP17Q9ULZ9 603 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 BRS3P32247 399 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 CLDN15P56746 228 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 AGBL5Q8NDL9 886 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 EXTL1Q92935 676 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 KLHDC7BQ96G42 594 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 PCED1AQ9H1Q7 454 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 ATP23Q9Y6H3 246 aa8.44□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 IGLV2-14P01704 120 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 HLA-HP01893 362 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 GYPAP02724 150 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 NPSP0C0P6 89 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 FOXL1Q12952 345 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 Q6ZRM9 215 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 OR1F12Q8NHA8 337 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 WDYHV1Q96HA8 205 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 A0A1W2PR77 199 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 VAMP5O95183 116 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 SCTP09683 121 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 IL3RAP26951 378 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 KMT5CQ86Y97 462 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 OR10G3Q8NGC4 313 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 LPAR2Q9HBW0 351 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 PLEK2Q9NYT0 353 aa8.43□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 LRP5LA4QPB2 252 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 TNFSF11O14788 317 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 SYNGR2O43760 224 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 LINC00310P59036 64 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 VWC2Q2TAL6 325 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 CALHM1Q8IU99 346 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 MYO7AQ13402 2215 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 FAM90A26D6RGX4 464 aa8.42□□□□□ -1.06
HCG18-242ENST00000602319 WISP2O76076 250 aa8.42□□□□□ -1.06
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