RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587743.1

SNHG16-205, Transcript of small nucleolar RNA host gene 16, human

Gene SNHG16, Length 2,665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG16-205	ENST00000587743	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	TECTB	Q96PL2	329 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	OR51B6	Q9H340	312 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	GDF1	P27539	372 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	TREM2	Q9NZC2	230 aa		13.52	□□□□□ -0.24
SNHG16-205	ENST00000587743	ARHGAP21	Q5T5U3	1957 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	TRAPPC2L	H3BP13	241 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	PPP1R2P9	O14990	202 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	IFNA5	P01569	189 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	HBE1	P02100	147 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	SERPINE2	P07093	398 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	KIR2DS4	P43632	304 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	KIR2DS1	Q14954	304 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF787	Q6DD87	383 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM210B	Q96KR6	192 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	CACNG5	Q9UF02	275 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	ESPL1	Q14674	2120 aa		13.52	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	FABP4	P15090	132 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	SGCZ	Q96LD1	299 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	CXorf65	A6NEN9	183 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	MRPL33	O75394	65 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	IGKV1-39	P01597	117 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	IGKV1D-39	P04432	117 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	FOLR3	P41439	243 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	DNAJC13	O75165	2243 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	CFI	P05156	583 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	CYC1	P08574	325 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	BCL2	P10415	239 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	MMP9	P14780	707 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	MKX	Q8IYA7	352 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	TCFL5	Q9UL49	500 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	CYTIP	O60759	359 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	DFFB	O76075	338 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	BEND4	Q6ZU67	534 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	CLDN23	Q96B33	292 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	OR2W1	Q9Y3N9	320 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	PGA5	P0DJD9	388 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	GAMT	Q14353	236 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	PSMF1	Q92530	271 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	SNX22	Q96L94	193 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	CD55	P08174	381 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	CELA3A	P09093	270 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	OR8G1	Q15617	311 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	SPINK14	Q6IE38	97 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	LRFN1	Q9P244	771 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SNHG16-205	ENST00000587743	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		13.49	□□□□□ -0.25

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