RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 KIF25Q9UIL4 384 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 VWFP04275 2813 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 TRAV24A0A0B4J272 114 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 LEUTXA8MZ59 168 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 CRYZL1O95825 349 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 IL7P13232 177 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 GTF2F2P13984 249 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 BRS3P32247 399 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 CEACAM3P40198 252 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 KIR2DS4P43632 304 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 RORCP51449 518 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 KRTAP10-3P60369 221 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 MED22Q15528 200 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 AWAT2Q6E213 333 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 ASCL4Q6XD76 172 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 Q6ZTK2 550 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF767PQ75MW2 155 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM219Q86XT9 240 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 GDPD1Q8N9F7 314 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF485Q8NCK3 441 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 SUN5Q8TC36 379 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 PIFOQ8TCI5 191 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 COQ2Q96H96 371 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 CITED1Q99966 193 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 MND1Q9BWT6 205 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 SRRQ9GZT4 340 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 OR51E2Q9H255 320 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 TCF19Q9Y242 345 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PTPRM-214ENST00000583153 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1W2PP11 408 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CCRL2O00421 344 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CTDSP2O14595 271 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CHST1O43916 411 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 GPX5O75715 221 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV3-7P01780 117 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 HSMCR30P0CW71 290 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 GDNFP39905 211 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 MNDAP41218 407 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 KCNJ3P48549 501 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 RBM11P57052 281 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 DOC2BQ14184 412 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 SPHARQ15513 63 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 C11orf88Q6PI97 169 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 IDO2Q6ZQW0 420 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 DUSP18Q8NEJ0 188 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 Q8NFD4 153 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 RFESDQ8TAC1 157 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC107Q8WV48 283 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 THRSPQ92748 146 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 OR5M11Q96RB7 305 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 MGLLQ99685 303 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CENPOQ9BU64 300 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 TMED9Q9BVK6 235 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF286AQ9HBT8 521 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CALYQ9NYX4 217 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 IL36GQ9NZH8 169 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 STUB1Q9UNE7 303 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 MEGF11A6BM72 1044 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 A6NDX4 124 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 MCRIP1C9JLW8 97 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRM-214ENST00000583153 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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