RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 SPACA5Q96QH8 159 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-210ENST00000561408 COPS4Q9BT78 406 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-210ENST00000561408 NDUFAF3Q9BU61 184 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-210ENST00000561408 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-210ENST00000561408 CENPMQ9NSP4 180 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-210ENST00000561408 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-210ENST00000561408 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-210ENST00000561408 SNX12Q9UMY4 172 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-210ENST00000561408 B9D1Q9UPM9 204 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-210ENST00000561408 SLC7A11Q9UPY5 501 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-210ENST00000561408 MPC1Q9Y5U8 109 aa3.16□□□□□ -1.9
TMOD3-210ENST00000561408 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.15□□□□□ -1.9
TMOD3-210ENST00000561408 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 PRORSD1PA6NEY8 169 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 TVP23AA6NH52 213 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 USP17L23D6RBM5 183 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 UBE2CO00762 179 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 HSD17B6O14756 317 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 S1PR2O95136 353 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 MOSP00540 346 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 RENP00797 406 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 TRGV3P03979 118 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 CD14P08571 375 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 CALCBP10092 127 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 GABRR1P24046 479 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 SLC6A6P31641 620 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 GLIPR1P48060 266 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 RAB7AP51149 207 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 ALDH3A2P51648 485 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 GNG3P63215 75 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 AESQ08117 197 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 MADCAM1Q13477 382 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 SCARB2Q14108 478 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 IRF3Q14653 427 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 C17orf58Q2M2W7 97 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 OAFQ86UD1 273 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM61Q8N0U2 210 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 OR8H3Q8N146 312 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 MREGQ8N565 214 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 OR52J3Q8NH60 311 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 OR9G1Q8NH87 305 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 CACNG8Q8WXS5 425 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 MBOAT4Q96T53 435 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 BARHL1Q9BZE3 327 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 OPA3Q9H6K4 179 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 DCDC2Q9UHG0 476 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 RIMS3Q9UJD0 308 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 HAO1Q9UJM8 370 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 COPS3Q9UNS2 423 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 PSG11Q9UQ72 335 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM5Q9Y2B1 443 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 MED31Q9Y3C7 131 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 U3KQV3 271 aa3.15□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 M0QX08 132 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 CDC42EP2O14613 210 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 CST4P01036 141 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 GABRB1P18505 474 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 RBM34P42696 430 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 HAAOP46952 286 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 CX3CR1P49238 355 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 SNU13P55769 128 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 TAS2R41P59536 307 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 MMDQ15546 238 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 TATDN3Q17R31 274 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 RPEL1Q2QD12 228 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 GCNT6Q5T4J0 391 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 DCXRQ7Z4W1 244 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 NOXA1Q86UR1 476 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 LCA5Q86VQ0 697 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 ANGPTL5Q86XS5 388 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 YIPF7Q8N8F6 280 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF114Q8NC26 417 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM104Q8NE00 496 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 OR4D6Q8NGJ1 314 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 OR10X1Q8NGY0 326 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 OR5B3Q8NH48 314 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 OR4A5Q8NH83 315 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 ZNRF4Q8WWF5 429 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 SLAMF6Q96DU3 332 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 FUT8Q9BYC5 575 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 ANKRD60Q9BZ19 345 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 HES4Q9HCC6 221 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 SDF2L1Q9HCN8 221 aa3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
TMOD3-210ENST00000561408 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms