RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	PAH	P00439	452 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	CHAT	P28329	748 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	GLIPR1	P48060	266 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	SCAND1	P57086	179 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	IDNK	Q5T6J7	187 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	TCF23	Q7RTU1	214 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	NDNF	Q8TB73	568 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	KPTN	Q9Y664	436 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		11.15	□□□□□ -0.62
CS-231	ENST00000552222	hADV38S2	A0JD32	116 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	ODAM	A1E959	279 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222		M0R1W7	72 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	SOCS1	O15524	211 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	ZNF273	Q14593	569 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222		Q8N7P7	452 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	CORO2A	Q92828	525 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	ISOC1	Q96CN7	298 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	CYYR1	Q96J86	154 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	KIF25	Q9UIL4	384 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	ETV7	Q9Y603	341 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		11.14	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PPH5	198 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222		H3BUX3	64 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	VEGFC	P49767	419 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	RORC	P51449	518 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	DLX6	P56179	175 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	TMEM50B	P56557	158 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	SPCS2	Q15005	226 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	NEK7	Q8TDX7	302 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	ING3	Q9NXR8	418 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	HSF4	Q9ULV5	492 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	SPATA2	Q9UM82	520 aa		11.13	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	UBE2J1	Q9Y385	318 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222		H3BMQ9	156 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	RAB27B	O00194	218 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	CHST1	O43916	411 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	CA11	O75493	328 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	MT-ND4	P03905	459 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	ZNF728	P0DKX0	622 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	CCL3L1	P16619	93 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	CD33	P20138	364 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	GAPT	Q8N292	157 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	ETAA1	Q9NY74	926 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		11.12	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	UBE2QL1	A1L167	161 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	BTBD17	A6NE02	478 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	C17orf98	A8MV24	154 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	FBXO24	O75426	580 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	RBP4	P02753	201 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	CGB3	P0DN86	165 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	CGB7	P0DN87	165 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	DYNC1I2	Q13409	638 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		11.11	□□□□□ -0.63
CS-231	ENST00000552222	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		11.11	□□□□□ -0.63

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