RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-229	ENST00000551936	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		11.44	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	LINC01548	A6NM66	108 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	C12orf77	C9JDV5	145 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	SLC31A2	O15432	143 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	RCN1	Q15293	331 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	C8orf59	Q8N0T1	100 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	STX19	Q8N4C7	294 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	TMEM104	Q8NE00	496 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	OR4K15	Q8NH41	348 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	CYYR1	Q96J86	154 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	BANF2	Q9H503	90 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	ETAA1	Q9NY74	926 aa		11.43	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	SERPINE3	A8MV23	424 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	SC5D	O75845	299 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	CEL	P19835	753 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	CD1B	P29016	333 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	ZNF134	P52741	427 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	WNT4	P56705	351 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	AWAT2	Q6E213	333 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	RAB12	Q6IQ22	244 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	STPG2	Q8N412	459 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936		Q8N9W7	124 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	BPIFB6	Q8NFQ5	453 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	SELENOI	Q9C0D9	397 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	ZFP57	Q9NU63	452 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		11.42	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	MYL12B	O14950	172 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	CASQ2	O14958	399 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	HBZ	P02008	142 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	GLA	P06280	429 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	MGMT	P16455	207 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	IL3RA	P26951	378 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	VHL	P40337	213 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	THBS3	P49746	956 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	ZNF137P	P52743	207 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	KRTAP10-11	P60412	298 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	C6orf183	Q5T699	404 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	AHSA2	Q719I0	299 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	OR1L1	Q8NH94	360 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936		Q96M66	194 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	ABCG5	Q9H222	651 aa		11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	UBE2QL1	A1L167	161 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	ERICH4	A6NGS2	130 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936		K7EIL1	84 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	SPINT2	O43291	252 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	CA11	O75493	328 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	MPIG6B	O95866	241 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	FUT3	P21217	361 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	SLC35B1	P78383	322 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	PRR18	Q8N4B5	295 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	COMMD1	Q8N668	190 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	RAB9B	Q9NP90	201 aa		11.4	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
CS-229	ENST00000551936	MOS	P00540	346 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CS-229	ENST00000551936	MYCNOS	P40205	109 aa		11.39	□□□□□ -0.59
CS-229	ENST00000551936	GPR12	P47775	334 aa		11.39	□□□□□ -0.59

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