RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	UPK3B	Q9BT76	320 aa		0.6	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	COPS4	Q9BT78	406 aa		0.6	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF426	Q9BUY5	554 aa		0.6	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	PECR	Q9BY49	303 aa		0.6	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		0.6	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	DDX18	Q9NVP1	670 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		0.6	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	STMN3	Q9NZ72	180 aa		0.6	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		0.6	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204		E7EWF7	191 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	SC5D	O75845	299 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	GIMD1	P0DJR0	217 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	SFTPC	P11686	197 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	BGN	P21810	368 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	RANBP1	P43487	201 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	AKR1C2	P52895	323 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	ATP5J2	P56134	94 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	BSPH1	Q075Z2	132 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	STK38	Q15208	465 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	FBXL15	Q9H469	300 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	RMND1	Q9NWS8	449 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	DOK5	Q9P104	306 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	SCML1	Q9UN30	329 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	PSMD13	Q9UNM6	376 aa		0.59	□□□□□ -2.31
MDM2-233	ENST00000545204	AK9	Q5TCS8	1911 aa		0.59	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		0.59	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	C8orf87	E5RJ46	101 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	UBD	O15205	165 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	EPPIN	O95925	133 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	CRYGC	P07315	174 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	DEK	P35659	375 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	DNASE1L1	P49184	302 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	SKP2	Q13309	424 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	PDGFRL	Q15198	375 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	ZBTB6	Q15916	424 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	FAM201A	Q5SY85	155 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	COA5	Q86WW8	74 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		0.58	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	PLCH2	O75038	1416 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	KIF27	Q86VH2	1401 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	CACNA1S	Q13698	1873 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204		K7EQS6	105 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	PSMD11	O00231	422 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	CDIPT	O14735	213 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	HMMR	O75330	724 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	LY6H	O94772	140 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	TPM2	P07951	284 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	STAG3L2	P0CL84	134 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	CD200	P41217	278 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	DEFA6	Q01524	100 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	TRAM1	Q15629	374 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	OR11H1	Q8NG94	326 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	OR10A6	Q8NH74	314 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	DTD1	Q8TEA8	209 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	GALM	Q96C23	342 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	0.57	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	DENND4B	O75064	1496 aa	Predicted RBP	0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204		B4DEV8	164 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204		H3BPC8	53 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204		J3QQQ9	107 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	hCG_2039718	K7EN88	272 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	FBP1	P09467	338 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	MAGEA12	P43365	314 aa		0.56	□□□□□ -2.32
MDM2-233	ENST00000545204	RPL26	P61254	145 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms