RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544675.1

NDUFA9-208, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9, human

TSL 4

Gene NDUFA9, Length 857 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NDUFA9-208	ENST00000544675	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	ESAM	Q96AP7	390 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	BTF3L4	Q96K17	158 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	ZNF681	Q96N22	645 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	GPR21	Q99679	349 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	ABHD6	Q9BV23	337 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	BANF2	Q9H503	90 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	PSG8	Q9UQ74	426 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	AK6	Q9Y3D8	172 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	MCM3AP	O60318	1980 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	C1orf226	A1L170	272 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	ARL5C	A6NH57	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675		E5RGE8	158 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	FFAR1	O14842	300 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	F2R	P25116	425 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	S100G	P29377	79 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	MLF1	P58340	268 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	TAS2R20	P59543	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	HSD52	Q0P140	79 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	OLIG2	Q13516	323 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	P2RY6	Q15077	328 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	ACKR1	Q16570	336 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	TMEM41B	Q5BJD5	291 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	RAET1L	Q5VY80	246 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	MDGA2	Q7Z553	956 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	OR4F17	Q8NGA8	305 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	OR4L1	Q8NH43	312 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	DOK4	Q8TEW6	326 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	SEC22A	Q96IW7	307 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	OR4F4	Q96R69	305 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	TPPP3	Q9BW30	176 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	VCX2	Q9H322	139 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	AHSP	Q9NZD4	102 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	KIAA1456	Q9P272	454 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	FBXL17	Q9UF56	701 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	TET1	Q8NFU7	2136 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675		F8WDY8	70 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	SLC17A3	O00476	420 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	LAT	O43561	262 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	NEURL1	O76050	574 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	IGHG3	P01860	377 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	HBZ	P02008	142 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	ZNF286B	P0CG31	522 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	PNMT	P11086	282 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	ACP5	P13686	325 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	OMG	P23515	440 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	CDK2	P24941	298 aa		4.84	□□□□□ -1.63
NDUFA9-208	ENST00000544675	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63

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