RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543190.5

LTBR-211, Transcript of lymphotoxin beta receptor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LTBR, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBR-211ENST00000543190 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 RAMP3O60896 148 aa14.66□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 IGF1P05019 195 aa14.66□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 ELANEP08246 267 aa14.66□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 IL3RAP26951 378 aa14.66□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 VHLP40337 213 aa14.66□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 CFHR3Q02985 330 aa14.66□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 Q499Y3 187 aa14.66□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 TRAT1Q6PIZ9 186 aa14.66□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 GHSRQ92847 366 aa14.66□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 PGLYRP3Q96LB9 341 aa14.66□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 S100A13Q99584 98 aa14.66□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 MOSP00540 346 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 IGHG4P01861 327 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 CD1AP06126 327 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 KIR2DS1Q14954 304 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 LY6G6FQ5SQ64 297 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 OR2G6Q5TZ20 316 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 C8orf86Q6ZUL3 223 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 MYOZ3Q8TDC0 251 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 C8orf4Q9NR00 106 aa14.65□□□□□ -0.06
LTBR-211ENST00000543190 AIPO00170 330 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 LALBAP00709 142 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 MYL12AP19105 171 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 SERPINA2P20848 420 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 HNF4GQ14541 408 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 C6orf183Q5T699 404 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 MOB3BQ86TA1 216 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 STX19Q8N4C7 294 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 ZNF555Q8NEP9 628 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 OR8U1Q8NH10 309 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 RAX2Q96IS3 184 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 S1PR3Q99500 378 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 DCLRE1BQ9H816 532 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 CKLFQ9UBR5 152 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 ING4Q9UNL4 249 aa14.64□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 TRAV39A0A0B4J263 110 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 A0A1W2PPE3 182 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 LINC01548A6NM66 108 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 C12orf77C9JDV5 145 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 CCL24O00175 119 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 SPINT2O43291 252 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 LANCL1O43813 399 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 RRP9O43818 475 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 MED21Q13503 144 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 FHL3Q13643 280 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 LTC4SQ16873 150 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 SLC22A6Q4U2R8 563 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 C18orf65Q6ZTR6 163 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 THRSPQ92748 146 aa14.63□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 MCRIP1C9JLW8 97 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 OR5H8P0DN80 308 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 PSMB8P28062 276 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 ZNF134P52741 427 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 TAS2R43P59537 309 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 DGCR2P98153 550 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 GPR50Q13585 617 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 CT45A1Q5HYN5 189 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 ATAD3CQ5T2N8 411 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 CT45A3Q8NHU0 189 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 TMEM80Q96HE8 168 aa14.62□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 A0A1W2PP11 408 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 MAGEA13PA6NCF6 341 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 NUDT19A8MXV4 375 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 DEFB121Q5J5C9 76 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 TTC23Q5W5X9 447 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 PACRGLQ8N7B6 248 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 C4orf3Q8WVX3 66 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 Q96M66 194 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 UQCC2Q9BRT2 126 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 GHRLQ9UBU3 117 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 LINC00527Q9UJ94 153 aa14.61□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 HBZP02008 142 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 FUT3P21217 361 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 SOX6P35712 828 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 REG1BP48304 166 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 HTD2P86397 168 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 RUNX1Q01196 453 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 CD69Q07108 199 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 DOC2BQ14184 412 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 RAB12Q6IQ22 244 aa14.6□□□□□ -0.07
LTBR-211ENST00000543190 C11orf87Q6NUJ2 197 aa14.6□□□□□ -0.07
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