RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534382.5

CTSB-231, Transcript of cathepsin B, human

TSL 4

Gene CTSB, Length 764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSB-231	ENST00000534382	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	UBALD1	Q8TB05	177 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	CYYR1	Q96J86	154 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	STUB1	Q9UNE7	303 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	RNF114	Q9Y508	228 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	ANK2	Q01484	3957 aa		11.69	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382		A0A0A6YYD4	124 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	IFITM5	A6NNB3	132 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	OOSP1	A8MZH6	123 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	C12orf77	C9JDV5	145 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	SOCS1	O15524	211 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	CHST1	O43916	411 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	BRS3	P32247	399 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	GNG10	P50151	68 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	OR10A3	P58181	314 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	LOXL3	P58215	753 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	HES5	Q5TA89	166 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	SSR3	Q9UNL2	185 aa		11.68	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	LDLRAD4	O15165	306 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	HBZ	P02008	142 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	KIR2DS4	P43632	304 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	PROK1	P58294	105 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	MADCAM1	Q13477	382 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	NEDD8	Q15843	81 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	TMEM219	Q86XT9	240 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	PRR18	Q8N4B5	295 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	DTX3	Q8N9I9	347 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	OR1L1	Q8NH94	360 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	RPE	Q96AT9	228 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		11.67	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	TNFAIP8	O95379	198 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	MNDA	P41218	407 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	TMEM50B	P56557	158 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382		Q3ZCU0	254 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	LINC00311	Q8N616	119 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	TOMM40L	Q969M1	308 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	OR51E2	Q9H255	320 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	RAB22A	Q9UL26	194 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	HSF4	Q9ULV5	492 aa		11.66	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382		A0A087WXM4	84 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382		A0A1W2PPE3	182 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	NAPSA	O96009	420 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	CD36	P16671	472 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	CD24	P25063	80 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	VEGFC	P49767	419 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	RAB7A	P51149	207 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	PLA2G7	Q13093	441 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382		Q6ZTK2	550 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	TPRA1	Q86W33	373 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	SGMS2	Q8NHU3	365 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	GNG12	Q9UBI6	72 aa		11.65	□□□□□ -0.54
CTSB-231	ENST00000534382	NOTO	A8MTQ0	251 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTSB-231	ENST00000534382	RAB6A	P20340	208 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTSB-231	ENST00000534382	GADD45A	P24522	165 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTSB-231	ENST00000534382	KRTAP10-3	P60369	221 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTSB-231	ENST00000534382	HTD2	P86397	168 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTSB-231	ENST00000534382	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
CTSB-231	ENST00000534382	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTSB-231	ENST00000534382	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTSB-231	ENST00000534382	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTSB-231	ENST00000534382	OR8H3	Q8N146	312 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTSB-231	ENST00000534382	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTSB-231	ENST00000534382	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		11.64	□□□□□ -0.55
CTSB-231	ENST00000534382	GALM	Q96C23	342 aa		11.64	□□□□□ -0.55

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