RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TXNL1O43396 289 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF254O75437 659 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPP14O95059 124 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FABP3P05413 133 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF134P52741 427 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDK5R1Q15078 307 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM177Q53S58 311 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CPOQ8IVL8 374 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC00311Q8N616 119 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCDC107Q8WV48 283 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DYDC1Q8WWB3 177 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PYURFQ96I23 114 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CHST5Q9GZS9 411 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PEMTQ9UBM1 199 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RNF150Q9ULK6 438 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AP3M1Q9Y2T2 418 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 R4GMQ9 66 aa7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MYCBP2O75592 4640 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H3BN98 237 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TNFRSF11BO00300 401 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KDM4BO94953 1096 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OCM2P0CE71 109 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ALDH3A2P51648 485 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ROM1Q03395 351 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MAPRE2Q15555 327 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q6ZWC4 215 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ARPINQ7Z6K5 226 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR52B4Q8NGK2 314 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TEX47Q8TBZ9 253 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADI1Q9BV57 179 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 YIPF3Q9GZM5 350 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MOB1AQ9H8S9 216 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DHDHQ9UQ10 334 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNX5Q9Y5X3 404 aa7.57□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0G2JLM5 398 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SHOXO15266 292 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GMNNO75496 209 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR2A4O95047 310 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCNB2O95067 398 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SEMG1P04279 462 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TCTAP57738 103 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AKIRIN2Q53H80 203 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CT45A1Q5HYN5 189 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 METTL21CQ5VZV1 264 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q6ZSR3 168 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CROCCP2Q86T23 111 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NPBQ8NG41 125 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CT45A3Q8NHU0 189 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MFFQ9GZY8 342 aa7.56□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C15orf65H3BRN8 121 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DEFB4AO15263 64 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRODHO43272 600 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATF1P18846 271 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCL1P22362 96 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIR2DS2P43631 304 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 APOC4P55056 127 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CXCR4P61073 352 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MOGAT2Q3SYC2 334 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TM4SF20Q53R12 229 aa7.55□□□□□ -1.2
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRR18Q8N4B5 295 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 POC5Q8NA72 575 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRPEL2Q8TAA5 225 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CNIH3Q8TBE1 160 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASB17Q8WXJ9 295 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TLCD1Q96CP7 247 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPAG4Q9NPE6 437 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GNG12Q9UBI6 72 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FBXL7Q9UJT9 491 aa7.55□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AIREO43918 545 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRT36O76013 467 aa7.54□□□□□ -1.2
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDUFA3O95167 84 aa7.54□□□□□ -1.2
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