RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532581.5

GRAMD1B-208, Transcript of GRAM domain containing 1B, human

TSL 2

Gene GRAMD1B, Length 2,615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CXCL1	P09341	107 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SELL	P14151	372 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	GGACT	Q9BVM4	153 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CD300LB	A8K4G0	201 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	DEGS1	O15121	323 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	YIF1A	O95070	293 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LHX2	P50458	406 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ERVFRD-1	P60508	538 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	OR51H1	Q8NH63	302 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	HLA-C	Q95604	372 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LSM10	Q969L4	123 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ZNF503-AS2	A6NEH8	195 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	OR5B21	A6NL26	309 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581		H3BP45	60 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PSG2	P11465	335 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ARR3	P36575	388 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SSPN	Q14714	243 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ZNF573	Q86YE8	665 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	DOK5	Q9P104	306 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	RNF150	Q9ULK6	438 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ZNHIT1	O43257	154 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	GNG13	Q9P2W3	67 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TGIF2-C20orf24	A0A0A6YYL0	155 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	IFITM10	A6NMD0	228 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	HS3ST1	O14792	307 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CER1	O95813	267 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	NGF	P01138	241 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	BCL2	P10415	239 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CD200	P41217	278 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	NDUFA6	P56556	154 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CLDN18	P56856	261 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	GNG3	P63215	75 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SRY	Q05066	204 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CT55	Q8WUE5	264 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	RDH5	Q92781	318 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ZNF488	Q96MN9	340 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LRFN1	Q9P244	771 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SYNGR4	O95473	234 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	F10	P00742	488 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	RNF224	P0DH78	156 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	S100A2	P29034	98 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ZNF787	Q6DD87	383 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PKIB	Q9C010	78 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	RPRM	Q9NS64	109 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PATE3	B3GLJ2	98 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SYNGR2	O43760	224 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SPINK14	Q6IE38	97 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581		Q6ZRM9	215 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	OR2M7	Q8NG81	312 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CACNG5	Q9UF02	275 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	ANKHD1-EIF4EBP3	H7C0V5	636 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CYB5B	O43169	146 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	HIST1H2BK	O60814	126 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	IGKV1-39	P01597	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	IGKV1D-39	P04432	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	HIST1H2BO	P23527	126 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRAMD1B-208	ENST00000532581	HIST1H2BB	P33778	126 aa		11.13	□□□□□ -0.63

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