RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527224.1

PACS1-205, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PACS1, Length 3,024 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-205ENST00000527224 IGKV1-33P01594 117 aa16■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa16■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 IAPPP10997 89 aa16■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 CD46P15529 392 aa16■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 CRISP2P16562 243 aa16■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 CTRLP40313 264 aa16■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 HERV-K104P61576 105 aa16■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 RPS18P62269 152 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 SLC24A4Q8NFF2 622 aa16■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa16■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 ANAPC16Q96DE5 110 aa16■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa16■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa16■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa15.99■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 WNT2P09544 360 aa15.99■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 SRP14P37108 136 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 TLE3Q04726 772 aa15.99■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 SFTPA2Q8IWL1 248 aa15.99■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 SLC46A1Q96NT5 459 aa15.99■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 FGF22Q9HCT0 170 aa15.99■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 VDAC3Q9Y277 283 aa15.99■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 CRYAAP02489 173 aa15.99■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 CTSEP14091 401 aa15.99■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 RAC2P15153 192 aa15.99■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 ARL16Q0P5N6 197 aa15.99■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 TBC1D26Q86UD7 250 aa15.99■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 MBD3L1Q8WWY6 194 aa15.99■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 DXOO77932 396 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 CISD3P0C7P0 127 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 PMCHP20382 165 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 C1orf174Q8IYL3 243 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 Q8N976 141 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 PATE1Q8WXA2 126 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 NPIPA2E9PIF3 369 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 TNFSF4P23510 183 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 PAFAH1B2P68402 229 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 GPM6BQ13491 265 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 DERL1Q9BUN8 251 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 TMEM222Q9H0R3 208 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 HIPK2Q9H2X6 1198 aa15.98■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 VSTM2BA6NLU5 285 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 ACRP10323 421 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 DTYMKP23919 212 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 OR1D4P47884 311 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 BAXQ07812 192 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 MFAP5Q13361 173 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 CORO2AQ92828 525 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 LRRC3BQ96PB8 259 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 AGMATQ9BSE5 352 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 BET1LQ9NYM9 111 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 CLN8Q9UBY8 286 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 IL19Q9UHD0 177 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 A0A0U1RQV5 110 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 OPN1LWP04000 364 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 BIDP55957 195 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 PRDX4Q13162 271 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 CARD17Q5XLA6 110 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 TIMM29Q9BSF4 260 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 ST3GAL6Q9Y274 331 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 C2orf72A6NCS6 295 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 TSPOP30536 169 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 PSMB3P49720 205 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 PMP22Q01453 160 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 OR10V1Q8NGI7 309 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 OR1K1Q8NGR3 316 aa15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 J3QW42 95 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 PAGE4O60829 102 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 LHX2P50458 406 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 EFNA3P52797 238 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 ZNF114Q8NC26 417 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 HSPB7Q9UBY9 170 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 LHFPL6Q9Y693 200 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 B4DGG1 531 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 GP1BBP13224 206 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 MPLP40238 635 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 VIPR2P41587 438 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 THBS3P49746 956 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 DNM1P34Q6PK57 102 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 RLN3Q8WXF3 142 aa15.96■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
PACS1-205ENST00000527224 SEC16AO15027 2179 aa15.96■□□□□ 0.14
PACS1-205ENST00000527224 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PACS1-205ENST00000527224 A0A0G2JRQ6 117 aa15.95■□□□□ 0.14
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