RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520608.2

ZNF260-201, Transcript of zinc finger protein 260, humanhuman

TSL 3

Gene ZNF260, Length 330 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260-201ENST00000520608 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 AIPO00170 330 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 FADS2O95864 444 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 ALPLP05186 524 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 CD2P06729 351 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 ELANEP08246 267 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 GZMHP20718 246 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 CD1BP29016 333 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 SOX6P35712 828 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 RBM11P57052 281 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 PPP3R1P63098 170 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 PAX5Q02548 391 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 EBI3Q14213 229 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 KIR2DS1Q14954 304 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 DDI2Q5TDH0 399 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 PRR18Q8N4B5 295 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 Q8N6K4 173 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 OR52N1Q8NH53 320 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 TMEM106AQ96A25 262 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 S1PR3Q99500 378 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 JAM3Q9BX67 310 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 AMBNQ9NP70 447 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 GNG12Q9UBI6 72 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 GMPPBQ9Y5P6 360 aa6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 C3orf84H3BNL1 204 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 C15orf65H3BRN8 121 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 SLC31A2O15432 143 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 SPINT2O43291 252 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 MYF6P23409 242 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 ALDH3A2P51648 485 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 F2RL1P55085 397 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 ZNF529Q6P280 563 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 TMEM65Q6PI78 240 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 LINC00596Q86U02 117 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 STX19Q8N4C7 294 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 LINC00311Q8N616 119 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 TMEM104Q8NE00 496 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 OR11H1Q8NG94 326 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 GPR148Q8TDV2 347 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 KCTD7Q96MP8 289 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 Q96MT0 163 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 OR5B12Q96R08 314 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 IFT22Q9H7X7 185 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 SCOCQ9UIL1 159 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.65□□□□□ -1.34
ZNF260-201ENST00000520608 TXNL1O43396 289 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 ORC5O43913 435 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 IGHG4P01861 327 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 OR8U8P0C7N1 319 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 OR5H8P0DN80 308 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 GTF2F2P13984 249 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 PSMB8P28062 276 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 CFHR3Q02985 330 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 RAB40BQ12829 278 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 MMDQ15546 238 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 MPV17LQ2QL34 196 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 ASCL4Q6XD76 172 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 CBR4Q8N4T8 237 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 RNF152Q8N8N0 203 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 Q8NFD4 153 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 OR52I1Q8NGK6 324 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 TMEM138Q9NPI0 162 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 PLSCR3Q9NRY6 295 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 IL36GQ9NZH8 169 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 A0A1W2PP11 408 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 C12orf77C9JDV5 145 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 MCRIP1C9JLW8 97 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF260-201ENST00000520608 ATP5HO75947 161 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms