RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515749.1

SEC31A-241, Transcript of SEC31 homolog A, COPII coat complex component, humanhuman

TSL 2

Gene SEC31A, Length 829 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31A-241ENST00000515749 PSPNO60542 156 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF737O75373 536 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 CD8AP01732 235 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 HEXAP06865 529 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 WNT2P09544 360 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 RPS2P15880 293 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 AADACP22760 399 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 DNASE1P24855 282 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 OR3A1P47881 315 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 SRPXP78539 464 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 MSMO1Q15800 293 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 IGFBP7Q16270 282 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 IGSF11Q5DX21 431 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 CLEC18BQ6UXF7 455 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 GSG1LQ6UXU4 331 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 Q6ZPA2 131 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 LRTM2Q8N967 370 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 ZBTB34Q8NCN2 500 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 OR2T35Q8NGX2 323 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM230Q96A57 120 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 GALMQ96C23 342 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 AKR1E2Q96JD6 320 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 SHARPINQ9H0F6 387 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF665Q9H7R5 613 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 COMMD9Q9P000 198 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.29□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 LGALS8O00214 317 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 BET1O15155 118 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 MPPED1O15442 326 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 SPINT2O43291 252 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 HSPA12AO43301 675 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 IFNA21P01568 189 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 EGR1P18146 543 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 IL2RGP31785 369 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 GABRA2P47869 451 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 PPOXP50336 477 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 PIGPP57054 158 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 HTD2P86397 168 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 AESQ08117 197 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 HERPUD1Q15011 391 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 MST1LQ2TV78 715 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 ESCO2Q56NI9 601 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 STUMQ69YW2 141 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 MUC15Q8N387 334 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 CD177Q8N6Q3 437 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 NINJ1Q92982 152 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 TOMM40LQ969M1 308 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 CYYR1Q96J86 154 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 GON7Q9BXV9 100 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 NMES1Q9C002 83 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 SLC5A7Q9GZV3 580 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 LIME1Q9H400 295 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 NAA60Q9H7X0 242 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 TAF9BQ9HBM6 251 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 ZFP57Q9NU63 452 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 ROS1P08922 2347 aa6.28□□□□□ -1.4
SEC31A-241ENST00000515749 PPIAL4EA0A075B759 164 aa6.27□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa6.27□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.27□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 ODAMA1E959 279 aa6.27□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.27□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 PPIAL4DF5H284 164 aa6.27□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 TMEM178BH3BS89 294 aa6.27□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 ITGB1BP1O14713 200 aa6.27□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 PPIAL4FP0DN26 164 aa6.27□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 SLC25A4P12235 298 aa6.27□□□□□ -1.41
SEC31A-241ENST00000515749 GNLYP22749 145 aa6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms