RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513020.5

SH3BP2-224, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 868 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-224ENST00000513020 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-224ENST00000513020 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-224ENST00000513020 RAB11BQ15907 218 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-224ENST00000513020 C6orf183Q5T699 404 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-224ENST00000513020 HES5Q5TA89 166 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-224ENST00000513020 C6orf201Q7Z4U5 140 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-224ENST00000513020 OR51D1Q8NGF3 324 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-224ENST00000513020 OR10X1Q8NGY0 326 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-224ENST00000513020 OR2T6Q8NHC8 308 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-224ENST00000513020 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-224ENST00000513020 TOMM40LQ969M1 308 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-224ENST00000513020 NEDD4LQ96PU5 975 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-224ENST00000513020 SULT4A1Q9BR01 284 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-224ENST00000513020 TM2D1Q9BX74 207 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-224ENST00000513020 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-224ENST00000513020 LPAR5Q9H1C0 372 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-224ENST00000513020 ZNF702PQ9H963 129 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-224ENST00000513020 GFOD1Q9NXC2 390 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-224ENST00000513020 LRRC42Q9Y546 428 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-224ENST00000513020 V9GY05 133 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP2-224ENST00000513020 H3BUI4 141 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 SPINT2O43291 252 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 CA11O75493 328 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 HBZP02008 142 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 GLAP06280 429 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 MYL9P24844 172 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 MNDAP41218 407 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 EFNB2P52799 333 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 OR10A3P58181 314 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 MADCAM1Q13477 382 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 C22orf42Q6IC83 251 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 TRAT1Q6PIZ9 186 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 ZNF773Q6PK81 442 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 OR2W3Q7Z3T1 314 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 C5orf24Q7Z6I8 188 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 OR10V1Q8NGI7 309 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 OR52M1Q8NGK5 317 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 OR1L1Q8NH94 360 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 FCGR1BQ92637 280 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 FAAP24Q9BTP7 215 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 ZNF696Q9H7X3 374 aa9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 A0A1W2PPI3 338 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 OOSP1A8MZH6 123 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 TIMM23O14925 209 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 SLC31A2O15432 143 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 SOCS1O15524 211 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 BLCAPP62952 87 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 PRR31Q5SQ13 230 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 Q6ZS46 218 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 KLHDC1Q8N7A1 406 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 OR56B4Q8NH76 319 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 CAPSLQ8WWF8 208 aa9.57□□□□□ -0.88
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SH3BP2-224ENST00000513020 SLC25A33Q9BSK2 321 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 TAF9BQ9HBM6 251 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 GNG12Q9UBI6 72 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 STEAP1Q9UHE8 339 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 SMIM30A4D0T7 59 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 PDCD5O14737 125 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 HSD17B6O14756 317 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 VSIG10L2P0DP72 767 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 RAB3BP20337 219 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 REG1BP48304 166 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 VEGFCP49767 419 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 RAB7AP51149 207 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 PSMD7P51665 324 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 PLA2G7Q13093 441 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 GNMTQ14749 295 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 TMEM95Q3KNT9 176 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 C2orf76Q3KRA6 126 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 DRAM1Q8N682 238 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 C11orf44Q8N8P7 122 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 ZNF439Q8NDP4 499 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 CFHR4Q92496 578 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 PRSS22Q9GZN4 317 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 RAB9BQ9NP90 201 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 SERTAD4Q9NUC0 356 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 KCNIP1Q9NZI2 227 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 LDLRAD4O15165 306 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 OR2F2O95006 317 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 GALP22466 123 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 ZNF134P52741 427 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SH3BP2-224ENST00000513020 HES1Q14469 280 aa9.55□□□□□ -0.88
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