RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	OPRL1	P41146	370 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	GABRA2	P47869	451 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	EMD	P50402	254 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	CTBP2	P56545	445 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	SMIM11A	P58511	58 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	LY6D	Q14210	128 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	EXOSC7	Q15024	291 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	SSX1	Q16384	188 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	C3AR1	Q16581	482 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	NRF1	Q16656	503 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	DUSP5	Q16690	384 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	LINC00471	Q8N535	108 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	BMPER	Q8N8U9	685 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	BEST4	Q8NFU0	473 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	KNL1	Q8NG31	2342 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	OR5D16	Q8NGK9	328 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	TMED6	Q8WW62	240 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC35E1	Q96K37	410 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	SDF2	Q99470	211 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	SYT3	Q9BQG1	590 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	TUBA4B	Q9H853	241 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	TCF19	Q9Y242	345 aa		5.78	□□□□□ -1.48
FBXO38-208	ENST00000504971	EYS	Q5T1H1	3165 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A087WUJ7	227 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM269	A0A1B0GVZ9	245 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1B0GX51	115 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1W2PRE2	83 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM74A7	A6NL05	159 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	TAAR5	O14804	337 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	DIRAS1	O95057	198 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	H2BFM	P0C1H6	154 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM225B	P0DP42	221 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	MED14OS	P0DP75	135 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	CD59	P13987	128 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	AZU1	P20160	251 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	LEP	P41159	167 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	SOX3	P41225	446 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	GLP1R	P43220	463 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	OR1D4	P47884	311 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	P2RY1	P47900	373 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	GNG4	P50150	75 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	MEOX1	P50221	254 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	BTG2	P78543	158 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	CDK5	Q00535	292 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	ID2	Q02363	134 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	SRY	Q05066	204 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	MXD1	Q05195	221 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	GPR50	Q13585	617 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	MELK	Q14680	651 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	GNMT	Q14749	295 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	RTP5	Q14D33	572 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF404	Q494X3	552 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	MEST	Q5EB52	335 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	DCST2	Q5T1A1	773 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF615	Q8N8J6	731 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF485	Q8NCK3	441 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	MORN4	Q8NDC4	146 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	OR4X1	Q8NH49	305 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	THAP6	Q8TBB0	222 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	C2CD4C	Q8TF44	421 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	OXGR1	Q96P68	337 aa		5.77	□□□□□ -1.49
FBXO38-208	ENST00000504971	OR6C1	Q96RD1	312 aa		5.77	□□□□□ -1.49

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