RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497700.1

ELL3-208, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

TSL 3

Gene ELL3, Length 574 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-208ENST00000497700 PLXNB1O43157 2135 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 MEIOCA2RUB1 952 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 TMEM235A6NFC5 223 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 G3V4G9 280 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 MFNGO00587 321 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 NPFFO15130 113 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 GNB3P16520 340 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 ARL6IP1Q15041 203 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 MPV17LQ2QL34 196 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 Q6ZTK2 550 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 RTN4RL2Q86UN3 420 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 C11orf44Q8N8P7 122 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 OR10Z1Q8NGY1 313 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 GPX8Q8TED1 209 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 C17orf50Q8WW18 174 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 PECRQ9BY49 303 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 PPA2Q9H2U2 334 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 HES4Q9HCC6 221 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 HSF4Q9ULV5 492 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 KCNK7Q9Y2U2 307 aa14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 BTBD17A6NE02 478 aa14.61□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 NDUFB3O43676 98 aa14.61□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 ORC5O43913 435 aa14.61□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 TSPAN9O75954 239 aa14.61□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 PRKACAP17612 351 aa14.61□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 PAX6P26367 422 aa14.61□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 CHATP28329 748 aa14.61□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 SAA4P35542 130 aa14.61□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 GUCA2AQ02747 115 aa14.61□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 IL13RA2Q14627 380 aa14.61□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 C2orf68Q2NKX9 166 aa14.61□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 STUMQ69YW2 141 aa14.61□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 SLC35E4Q6ICL7 350 aa14.61□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 LINC00596Q86U02 117 aa14.61□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 SETD6Q8TBK2 473 aa14.61□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 TNFRSF14Q92956 283 aa14.61□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 DCTN5Q9BTE1 182 aa14.61□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 MTFP1Q9UDX5 166 aa14.61□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 TBC1D24Q9ULP9 559 aa14.61□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 H3BUI4 141 aa14.6□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 CA11O75493 328 aa14.6□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 RBBP9O75884 186 aa14.6□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 NXPH2O95156 264 aa14.6□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 LPLP06858 475 aa14.6□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 CSF1P09603 554 aa14.6□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 GDNFP39905 211 aa14.6□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 INPP1P49441 399 aa14.6□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 ASAH1Q13510 395 aa14.6□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa14.6□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.6□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa14.6□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 ZNF581Q9P0T4 197 aa14.6□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 IL36RNQ9UBH0 155 aa14.6□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 KLK11Q9UBX7 282 aa14.6□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 SERPINE3A8MV23 424 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 PLA2G10O15496 165 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 PDCD6O75340 191 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 PTTG1O95997 202 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 FUT3P21217 361 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 SNU13P55769 128 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 LY6EQ16553 131 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 C6orf201Q7Z4U5 140 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 POC5Q8NA72 575 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 PPP1R35Q8TAP8 253 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 GAFA1Q96PS6 74 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 IFT22Q9H7X7 185 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 RASL12Q9NYN1 266 aa14.59□□□□□ -0.07
ELL3-208ENST00000497700 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa14.58□□□□□ -0.08
ELL3-208ENST00000497700 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa14.58□□□□□ -0.08
ELL3-208ENST00000497700 SSX5O60225 188 aa14.58□□□□□ -0.08
ELL3-208ENST00000497700 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ELL3-208ENST00000497700 GSTT2BP0CG30 244 aa14.58□□□□□ -0.08
ELL3-208ENST00000497700 DUSP1P28562 367 aa14.58□□□□□ -0.08
ELL3-208ENST00000497700 GNG2P59768 71 aa14.58□□□□□ -0.08
ELL3-208ENST00000497700 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ELL3-208ENST00000497700 ZNF146Q15072 292 aa14.58□□□□□ -0.08
ELL3-208ENST00000497700 LRRC10Q5BKY1 277 aa14.58□□□□□ -0.08
ELL3-208ENST00000497700 NKAPLQ5M9Q1 402 aa14.58□□□□□ -0.08
ELL3-208ENST00000497700 ACP7Q6ZNF0 438 aa14.58□□□□□ -0.08
ELL3-208ENST00000497700 TOMM5Q8N4H5 51 aa14.58□□□□□ -0.08
ELL3-208ENST00000497700 CYYR1Q96J86 154 aa14.58□□□□□ -0.08
ELL3-208ENST00000497700 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ELL3-208ENST00000497700 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa14.57□□□□□ -0.08
ELL3-208ENST00000497700 H3BUX3 64 aa14.57□□□□□ -0.08
ELL3-208ENST00000497700 GLRA1P23415 457 aa14.57□□□□□ -0.08
ELL3-208ENST00000497700 BCAP31P51572 246 aa14.57□□□□□ -0.08
ELL3-208ENST00000497700 ARFRP1Q13795 201 aa14.57□□□□□ -0.08
ELL3-208ENST00000497700 BEAN1Q3B7T3 259 aa14.57□□□□□ -0.08
ELL3-208ENST00000497700 SPIN3Q5JUX0 258 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.5 ms