RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	LILRA1	O75019	489 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	MALL	Q13021	153 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	METRNL	Q641Q3	311 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	DOCK1	Q14185	1865 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	BLACE	A4D250	179 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549		H3BUT2	72 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	BMPR1B	O00238	502 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	CA2	P00918	260 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	HLA-DQA1	P01909	254 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	FCGR2A	P12318	317 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF17	P17021	662 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	MLF2	Q15773	248 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	NNAT	Q16517	81 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	FDX2	Q6P4F2	183 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	TCF23	Q7RTU1	214 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	KCNIP2	Q9NS61	270 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLEC1B	Q9P126	229 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	CD207	Q9UJ71	328 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	RBM14-RBM4	A0A0A0MSL8	147 aa	Known RBP	7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1B0GUS0	222 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549		H3BMH7	237 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	GPX1	P07203	203 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	VDAC1	P21796	283 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	CEACAM3	P40198	252 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	RELB	Q01201	579 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLAC9	Q5JTB6	97 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	OTP	Q5XKR4	325 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	LRRC61	Q9BV99	259 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	WDR90	Q96KV7	1748 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	PPIAL4D	F5H284	164 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	DEGS1	O15121	323 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	IAPP	P10997	89 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	FOXL1	Q12952	345 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	WBP2	Q969T9	261 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	GCM1	Q9NP62	436 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	THYN1	Q9P016	225 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRSS37	A4D1T9	235 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF840P	A6NDX5	716 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	SERINC4	A6NH21	518 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549		G3V4G9	280 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	TIAF1	O95411	115 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	CFP	P27918	469 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	SRI	P30626	198 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	FUT6	P51993	359 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	RHOG	P84095	191 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM187	Q14656	261 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	MUC21	Q5SSG8	566 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR4C46	A6NHA9	309 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLPP3	O14495	311 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLC31A1	O15431	190 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	NEURL1	O76050	574 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	APCS	P02743	223 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	C3orf79	P0CE67	100 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	DRD1	P21728	446 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	UCP1	P25874	307 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	RAB37	Q96AX2	223 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	MMP25	Q9NPA2	562 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANK1	P16157	1881 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549		F5H5K5	113 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CRNKL1-205	ENST00000496549	IFNL4	K9M1U5	179 aa		7.11	□□□□□ -1.27

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