RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 ETAA1Q9NY74 926 aa4.71□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 DHDHQ9UQ10 334 aa4.71□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 A3GALT2U3KPV4 340 aa4.71□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 SAC3D1A6NKF1 404 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 MAGEB3O15480 346 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 APOL3O95236 402 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 BAG2O95816 211 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 CGB3P0DN86 165 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 CGB7P0DN87 165 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 DBTP11182 482 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 OSMP13725 252 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 ATF1P18846 271 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 GZMHP20718 246 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 KCNJ3P48549 501 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 DAPP51397 102 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 ACTBP60709 375 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 PLGLAQ15195 96 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 RCN1Q15293 331 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 Q6P435 159 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 MINDY2Q8NBR6 621 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 OR9G4Q8NGQ1 327 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 CASTOR1Q8WTX7 329 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 DNAJC9Q8WXX5 260 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 SPACA5Q96QH8 159 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 PRRG3Q9BZD7 231 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 RNF150Q9ULK6 438 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 OAZ3Q9UMX2 235 aa4.7□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 NBR2O15453 112 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 MITFO75030 526 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 NDUFB8O95169 186 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 IGKV1D-12P01611 117 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 IGHV3-43DP0DP04 118 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 TMEM225BP0DP42 221 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 MED14OSP0DP75 135 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 CRISP1P54107 249 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 LSAMPQ13449 338 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 TATDN3Q17R31 274 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 C5orf64Q2M2E5 130 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 Q3ZCU0 254 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 ACTBL2Q562R1 376 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 KDM4DQ6B0I6 523 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 LGALS9CQ6DKI2 356 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 LIN54Q6MZP7 749 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 UTS2BQ765I0 119 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 FAM220AQ7Z4H9 259 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 SAXO1Q8IYX7 474 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 CBR4Q8N4T8 237 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 LINC00311Q8N616 119 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 TCEANCQ8N8B7 351 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 C8orf31Q8N9H6 132 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 OR52M1Q8NGK5 317 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 ARL11Q969Q4 196 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 TMEM106AQ96A25 262 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 MS4A10Q96PG2 267 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 CIB1Q99828 191 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 NEURL2Q9BR09 285 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 C9orf16Q9BUW7 83 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 ANKRD60Q9BZ19 345 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 SLA2Q9H6Q3 261 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 SRD5A3Q9H8P0 318 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 RAB9BQ9NP90 201 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 TPSG1Q9NRR2 321 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 CLN6Q9NWW5 311 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 GFOD1Q9NXC2 390 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 TVP23BQ9NYZ1 205 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 GNG12Q9UBI6 72 aa4.69□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 TRAV39A0A0B4J263 110 aa4.68□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa4.68□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 A0A0G2JLM5 398 aa4.68□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa4.68□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 CCDC182A6NF36 153 aa4.68□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 EI24O14681 340 aa4.68□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 TRGV3P03979 118 aa4.68□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 ALDH3A2P51648 485 aa4.68□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 SYNJ2BPP57105 145 aa4.68□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 CDK5Q00535 292 aa4.68□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 PAX5Q02548 391 aa4.68□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 IL13RA2Q14627 380 aa4.68□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 CDK5R1Q15078 307 aa4.68□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
CBX1-205ENST00000495350 LRRC36Q1X8D7 754 aa4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms