RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493853.1

RBM39-238, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 4

Gene RBM39, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-238	ENST00000493853	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		5.99	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		5.99	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	OR52N1	Q8NH53	320 aa		5.99	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		5.99	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	DPF1	Q92782	380 aa		5.99	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	LEAP2	Q969E1	77 aa		5.99	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	ARL11	Q969Q4	196 aa		5.99	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	SLC29A1	Q99808	456 aa		5.99	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF649	Q9BS31	505 aa		5.99	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		5.99	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	RAB9B	Q9NP90	201 aa		5.99	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		5.99	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	AURKAIP1	Q9NWT8	199 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		5.99	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	CKLF	Q9UBR5	152 aa		5.99	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	NOTCH1	P46531	2555 aa		5.99	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853		A0A1W2PPE3	182 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	CCRL2	O00421	344 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	IGKV1D-33	P01593	117 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	IGKV1-33	P01594	117 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	AMY1A	P04745	511 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	CGB3	P0DN86	165 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	CGB7	P0DN87	165 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	GTF2F2	P13984	249 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	SERPINA2	P20848	420 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	IL3RA	P26951	378 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	BDKRB2	P30411	391 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	SSTR5	P35346	364 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	ETV1	P50549	477 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	RIPK1	Q13546	671 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	GPR176	Q14439	515 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	LINC00596	Q86U02	117 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	CCDC107	Q8WV48	283 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	CYGB	Q8WWM9	190 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	S100A14	Q9HCY8	104 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	FGF20	Q9NP95	211 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853		E9PQ18	207 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	AIP	O00170	330 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	EBAG9	O00559	213 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	HSD17B6	O14756	317 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	SPINT2	O43291	252 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	FGF16	O43320	207 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	LIMS3	P0CW19	117 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	LIMS4	P0CW20	117 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	REG1B	P48304	166 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	PAX5	Q02548	391 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	UTF1	Q5T230	341 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	TTC23	Q5W5X9	447 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF529	Q6P280	563 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	ASCL4	Q6XD76	172 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	COMMD1	Q8N668	190 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853		Q8NFD4	153 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	GHSR	Q92847	366 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	TMEM80	Q96HE8	168 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	RDH12	Q96NR8	316 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	GON7	Q9BXV9	100 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	ZFP57	Q9NU63	452 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RBM39-238	ENST00000493853	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		5.97	□□□□□ -1.45

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.6 ms