RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-206ENST00000487539 RABEP2Q9H5N1 569 aa3.1□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 TPT1P8Q9HAU6 139 aa3.1□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 Q9N2K0 584 aa3.1□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 ATPIF1Q9UII2 106 aa3.1□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 SNX12Q9UMY4 172 aa3.1□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 NACAE9PAV3 2078 aa3.1□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 PRSS37A4D1T9 235 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 FAM183AA6NL82 134 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 C15orf61A6NNL5 157 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 H3BQF6 201 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 K7N7A8 449 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 M0R135 149 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 LGALS9O00182 355 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 ARPC2O15144 300 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 ZNF737O75373 536 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 KRT75O95678 551 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 RBP4P02753 201 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 IFNA4P05014 189 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 CPA3P15088 417 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 ACKR3P25106 362 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 BMI1P35226 326 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 GPR4P46093 362 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 OR1E2P47887 323 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 SERPINB9P50453 376 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 GPM6AP51674 278 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 SYNJ2BPP57105 145 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 MZT1Q08AG7 82 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 PRDX4Q13162 271 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 EDDM3AQ14507 147 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 RGNQ15493 299 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 HLA-DRB5Q30154 266 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 HDDC2Q7Z4H3 204 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 PGAM4Q8N0Y7 254 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 ZNF561Q8N587 486 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 C11orf45Q8TAV5 145 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 UBALD1Q8TB05 177 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 LIPHQ8WWY8 451 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 FRZBQ92765 325 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 LEAP2Q969E1 77 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 MOB3AQ96BX8 217 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 ZNF799Q96GE5 643 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 RNF170Q96K19 258 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 OR52E6Q96RD3 313 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 ABHD1Q96SE0 405 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 GGTLC1Q9BX51 225 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 FUT8Q9BYC5 575 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 SYT4Q9H2B2 425 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 OR51I2Q9H344 312 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 PLEKHA1Q9HB21 404 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 POLR1DQ9Y2S0 133 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa3.09□□□□□ -1.91
CNN3-206ENST00000487539 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 A0A1W2PPE3 182 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 A0A1W2PPQ1 181 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 TRAPPC13A5PLN9 417 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 A6NIZ1 184 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 ZNF732B4DXR9 585 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 E9PBE3 544 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 F8VVB4 439 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 F8VWA3 439 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 SLC1A7O00341 560 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 RFXANKO14593 260 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 TRBV12-3P01733 135 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 CDK2P24941 298 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 REG1BP48304 166 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 CRYBA2P53672 197 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 RAP1BP61224 184 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 RAP1AP62834 184 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 LCN12Q6JVE5 192 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 MSRB3Q8IXL7 192 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 MMD2Q8IY49 270 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 Q8N402 240 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 TRIML2Q8N7C3 387 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 CYB561A3Q8NBI2 242 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 OR9G4Q8NGQ1 327 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 OR13C2Q8NGS9 318 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 AQP3Q92482 292 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 PIGCQ92535 297 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 RCN3Q96D15 328 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 S1PR3Q99500 378 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 MICU1Q9BPX6 476 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 GON7Q9BXV9 100 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 TMED3Q9Y3Q3 217 aa3.08□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 C5orf58C9J3I9 102 aa3.07□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 DLGAP1O14490 977 aa3.07□□□□□ -1.92
CNN3-206ENST00000487539 AHCYL1O43865 530 aa3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms