RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485792.1

CUX1-208, Transcript of cut like homeobox 1, human

TSL 5

Gene CUX1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CUX1-208	ENST00000485792	TRGV10	A0A0A0MS01	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792		A0A0B4J203	849 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792		A6NDX4	124 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	HSPB6	O14558	160 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	ORC5	O43913	435 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	GPR137B	O60478	399 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	IL1A	P01583	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	MAS1	P04201	325 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF44	P15621	663 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	MGMT	P16455	207 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	FUT3	P21217	361 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	OMG	P23515	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	GABRR1	P24046	479 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	CDK2	P24941	298 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	CHAT	P28329	748 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	KIR2DS4	P43632	304 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF137P	P52743	207 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	EDDM3B	P56851	147 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	OR10A3	P58181	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	LSAMP	Q13449	338 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	EBI3	Q14213	229 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	OR52W1	Q6IF63	320 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	OR10K2	Q6IF99	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF773	Q6PK81	442 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792		Q6ZSV7	163 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	LINC01006	Q8NI28	216 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	UBALD1	Q8TB05	177 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	GPER1	Q99527	375 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	SSX3	Q99909	188 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	CITED1	Q99966	193 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	NICN1	Q9BSH3	213 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	TMED9	Q9BVK6	235 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	ING4	Q9UNL4	249 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792		X6R8D5	127 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CUX1-208	ENST00000485792	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	SMIM30	A4D0T7	59 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	OOSP1	A8MZH6	123 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792		H3BUI4	141 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792		J3QR06	171 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	CCRL2	O00421	344 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	SLC31A2	O15432	143 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	PDCD6	O75340	191 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	ARL6IP5	O75915	188 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	OR7C1	O76099	320 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	AMY1A	P04745	511 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	AMY2A	P04746	511 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	SERPINA2	P20848	420 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	COX7A1	P24310	79 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	HTR2C	P28335	458 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	SSTR5	P35346	364 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	PSMD7	P51665	324 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	ZNF134	P52741	427 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	EFNB2	P52799	333 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	CFHR4	Q92496	578 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	FCGR1B	Q92637	280 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	LEAP2	Q969E1	77 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	PTX4	Q96A99	478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CUX1-208	ENST00000485792	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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