RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 GPX5O75715 221 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 MYCNOSP40205 109 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 EBI3Q14213 229 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 TMEM30BQ3MIR4 351 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 Q3ZCU0 254 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 TEX38Q6PEX7 206 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 TRAT1Q6PIZ9 186 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 ZNF497Q6ZNH5 498 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 C8orf86Q6ZUL3 223 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 OR2W3Q7Z3T1 314 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 IZUMO1Q8IYV9 350 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 DHRSXQ8N5I4 330 aa15.93■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PPK0 400 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 RRP9O43818 475 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 MOSP00540 346 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 LALBAP00709 142 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 MAS1P04201 325 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 FSTP19883 344 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 CD1BP29016 333 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 RAB12Q6IQ22 244 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 OR4K15Q8NH41 348 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 THRSPQ92748 146 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 OR14A2Q96R54 314 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 ABCG5Q9H222 651 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 KCNIP1Q9NZI2 227 aa15.92■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 NOTCH3Q9UM47 2321 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 EFCAB10A6NFE3 127 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 K7EIL1 84 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 MYL12BO14950 172 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 CAPGP40121 348 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 RAB25P57735 213 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 ST3GAL4Q11206 333 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 ZNF695Q8IW36 515 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 CDH26Q8IXH8 852 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 PACRGLQ8N7B6 248 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 OR8H1Q8NGG4 311 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 SELENOIQ9C0D9 397 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 PEX16Q9Y5Y5 336 aa15.91■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 MAGEA13PA6NCF6 341 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 CA11O75493 328 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 GPR12P47775 334 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 DOC2BQ14184 412 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 GGHQ92820 318 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 PGLYRP3Q96LB9 341 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 BANF2Q9H503 90 aa15.9■□□□□ 0.14
ACTB-212ENST00000484841 C12orf77C9JDV5 145 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 MGMTP16455 207 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 VDAC1P21796 283 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 GP2P55259 537 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP10-11P60412 298 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.131e-9■□□□□ 9
ACTB-212ENST00000484841 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 GPR50Q13585 617 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 ETV3LQ6ZN32 361 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 NKAIN3Q8N8D7 197 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 Q8N9W7 124 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 OR10V1Q8NGI7 309 aa15.89■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 FAM90A10PA6NDY2 464 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 FAM90A7PA6NKC0 464 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 HBZP02008 142 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 CELP19835 753 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 FUT3P21217 361 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 CD69Q07108 199 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 VAX1Q5SQQ9 334 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 Q8N6K4 173 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 S1PR3Q99500 378 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 CST11Q9H112 138 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 OR2S2Q9NQN1 319 aa15.88■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 UBE2QL1A1L167 161 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 LINC01548A6NM66 108 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 GLAP06280 429 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 SOX6P35712 828 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 WNT4P56705 351 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 STEAP3Q658P3 488 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 C18orf65Q6ZTR6 163 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 AHSA2Q719I0 299 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 OR1L1Q8NH94 360 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 TFAP2CQ92754 450 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 DERL3Q96Q80 235 aa15.87■□□□□ 0.13
ACTB-212ENST00000484841 GHRLQ9UBU3 117 aa15.87■□□□□ 0.13
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