RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 LINC01548A6NM66 108 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 C12orf77C9JDV5 145 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 SLC31A2O15432 143 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 HBZP02008 142 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 HSMCR30P0CW71 290 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 MYF6P23409 242 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 WNT4P56705 351 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 GPR50Q13585 617 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 INSL4Q14641 139 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 OR10K2Q6IF99 312 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00596Q86U02 117 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM104Q8NE00 496 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 OR10A7Q8NGE5 316 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 IL1F10Q8WWZ1 152 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 DERL3Q96Q80 235 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 CCDC90BQ9GZT6 254 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 TAF9BQ9HBM6 251 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 OR2S2Q9NQN1 319 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 IL36GQ9NZH8 169 aa6.4□□□□□ -1.38
CTPS1-209ENST00000480420 C15orf65H3BRN8 121 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 ORC5O43913 435 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 MOSP00540 346 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 FUT3P21217 361 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 DOC2BQ14184 412 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 GNMTQ14749 295 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 MED22Q15528 200 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 TMEM203Q969S6 136 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 CYYR1Q96J86 154 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 KCNK15Q9H427 330 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 RAB9BQ9NP90 201 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 C8orf4Q9NR00 106 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 SCN3BQ9NY72 215 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.39□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 FGF16O43320 207 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 FAM90A13PP0C7W8 464 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 FSTP19883 344 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 VDAC1P21796 283 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 GPR12P47775 334 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 MMDQ15546 238 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 DEFB136Q30KP8 78 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF695Q8IW36 515 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 STPG2Q8N412 459 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 NANOGP1Q8N7R0 232 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.38□□□□□ -1.39
CTPS1-209ENST00000480420 Q8NFD4 153 aa6.38□□□□□ -1.39
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