RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CORTO00230 105 aa15.01□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CDIPTO14735 213 aa15.01□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DOLPP1Q86YN1 238 aa15.01□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IFITM10A6NMD0 228 aa15.01□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR1L1Q8NH94 360 aa15.01□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VSTM2AQ8TAG5 236 aa15.01□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATG101Q9BSB4 218 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM204Q9BSN7 226 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ISLRO14498 428 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MMP9P14780 707 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM117AQ9C073 453 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CEP290O15078 2479 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRAV39A0A0B4J263 110 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNF224P0DH78 156 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IFITM2Q01629 132 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR2M3Q8NG83 312 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR4A4PQ8NGN8 299 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RASL10BQ96S79 203 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHST5Q9GZS9 411 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BCL2P10415 239 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CD40P25942 277 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM209BQ5JX69 171 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPINK14Q6IE38 97 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR4X1Q8NH49 305 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GRAMD2BQ96HH9 432 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GDF15Q99988 308 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WDFY1Q8IWB7 410 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR52L2PQ8NGH6 319 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTX4Q96A99 478 aa15□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PPIHO43447 177 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TUSC5Q8IXB3 177 aa14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLN8Q9UBY8 286 aa14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NPTNQ9Y639 398 aa14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF137PP52743 207 aa14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RPL30P62888 115 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RUNX1Q01196 453 aa14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LDLRAD3Q86YD5 345 aa14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM140Q9NV12 185 aa14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRIP11Q15643 1979 aa14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A1W2PPC1 479 aa14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRGC2P03986 189 aa14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CD1AP06126 327 aa14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CACNA1CQ13936 2221 aa14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MT-CO3P00414 261 aa14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HLA-DQB1P01920 261 aa14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HERVK_113P61574 105 aa14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF788Q6ZQV5 615 aa14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CARFQ8N187 725 aa14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF519Q8TB69 540 aa14.99□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 H3BVH4 76 aa14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ORM1P02763 201 aa14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RHBDD2Q6NTF9 364 aa14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF343Q6P1L6 599 aa14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMDT1Q9H4I9 107 aa14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CES1P1Q9UKY3 287 aa14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RHBDL1O75783 438 aa14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMIM12Q96EX1 92 aa14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TEPPQ6URK8 271 aa14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TREM2Q9NZC2 230 aa14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM157AC9JC47 383 aa14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MMP16P51512 607 aa14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 STAG3L2P0CL84 134 aa14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SRP14P37108 136 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WNT5AP41221 380 aa14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PAFAH1B2P68402 229 aa14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PERPQ96FX8 193 aa14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KCNK7Q9Y2U2 307 aa14.98□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMPRSS2O15393 492 aa14.97□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.97□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 WNT2BQ93097 391 aa14.97□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRNDQ9UKY0 176 aa14.97□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PGLYRP3Q96LB9 341 aa14.97□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNF122Q9H9V4 155 aa14.97□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TINAGQ9UJW2 476 aa14.97□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM108Q6UXF1 575 aa14.97□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RHOVQ96L33 236 aa14.97□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR4C12Q96R67 309 aa14.97□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPR35Q9HC97 309 aa14.97□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ASCL3Q9NQ33 180 aa14.97□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CFDP00746 253 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FCGR3AP08637 254 aa14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms