RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	RAB11B	Q15907	218 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	OR56B4	Q8NH76	319 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF702P	Q9H963	129 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	ACOT13	Q9NPJ3	140 aa		11.89	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	C12orf77	C9JDV5	145 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	ORC5	O43913	435 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	SC5D	O75845	299 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	HBZ	P02008	142 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	ARSB	P15848	533 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	IL3RA	P26951	378 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	EFNB2	P52799	333 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	GABARAPL2	P60520	117 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	BLCAP	P62952	87 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	HNF4G	Q14541	408 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	HERPUD1	Q15011	391 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	C11orf88	Q6PI97	169 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	MOB3B	Q86TA1	216 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	LYPD6	Q86Y78	171 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	DRAM1	Q8N682	238 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	OR1L1	Q8NH94	360 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	CYYR1	Q96J86	154 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	NICN1	Q9BSH3	213 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		11.88	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	OOSP1	A8MZH6	123 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	C15orf65	H3BRN8	121 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	CCRL2	O00421	344 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	HSD17B6	O14756	317 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	SLC22A1	O15245	554 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	BPNT1	O95861	308 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	FAM106CP	P0CH98	169 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	MYL9	P24844	172 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	CLDN12	P56749	244 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	HES5	Q5TA89	166 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	LYG1	Q8N1E2	194 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		11.87	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	CA11	O75493	328 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	LPL	P06858	475 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	CSF1	P09603	554 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM11	P17152	192 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	RAB7A	P51149	207 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	UNC119	Q13432	240 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		11.86	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	LY6L	H3BQJ8	138 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	SLC17A2	O00624	439 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	PDCD5	O14737	125 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	FBXO24	O75426	580 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	OR2F2	O95006	317 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	TSPAN15	O95858	294 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	GLA	P06280	429 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	CHAT	P28329	748 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	SSX1	Q16384	188 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	FBLN7	Q53RD9	439 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880		Q6ZS46	218 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	GFI1	Q99684	422 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880		V9GY05	133 aa		11.85	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	NOTCH1	P46531	2555 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PPI3	338 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	SMIM30	A4D0T7	59 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	SLC31A2	O15432	143 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	SOCS1	O15524	211 aa		11.84	□□□□□ -0.51
SSR4-208	ENST00000471880	DENR	O43583	198 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51

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