RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 PBOV1Q9GZY1 135 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 DKK4Q9UBT3 224 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 PIN1P1O15428 100 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 NRASP01111 189 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 HRASP01112 189 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 KRASP01116 189 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 STUMQ69YW2 141 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 TUSC5Q8IXB3 177 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 PTX4Q96A99 478 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 SPSB1Q96BD6 273 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 REEP6Q96HR9 211 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 SLC22A13Q9Y226 551 aa6.67□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 A0A0J9YW62 118 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 P2RY10O00398 339 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 CHEK1O14757 476 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 THBS4P35443 961 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 BSXQ3C1V8 233 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 MPC1Q9Y5U8 109 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 A0A1B0GV72 72 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 GPANK1O95872 356 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 NPBWR1P48145 328 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 PHLDA2Q53GA4 152 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 OR5AU1Q8NGC0 362 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 OR2AE1Q8NHA4 323 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 TMEM45BQ96B21 275 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 GPR35Q9HC97 309 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 ASCL3Q9NQ33 180 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 OR5B21A6NL26 309 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 PRR32B1ATL7 298 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 CT45A6P0DMU7 189 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 CT45A5P0DMU8 189 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 CT45A7P0DMV0 189 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 P2RY4P51582 365 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 ELLP55199 621 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 ELOBQ15370 118 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 HIST3H3Q16695 136 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 Q6ZS92 163 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 C20orf196Q8IYI0 205 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 RAB40CQ96S21 281 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 LIPGQ9Y5X9 500 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 PIEZO1Q92508 2521 aa6.66□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 SH2D1BO14796 132 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 SPINT2O43291 252 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 CRISP2P16562 243 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 PPP1R1AQ13522 171 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 NHLRC1Q6VVB1 395 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 STARD4Q96DR4 205 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 MS4A3Q96HJ5 214 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 AMELYQ99218 206 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 ATG101Q9BSB4 218 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 RNF122Q9H9V4 155 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 FBXL17Q9UF56 701 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 OR5V1Q9UGF6 321 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 TTRP02766 147 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 HPXP02790 462 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 ARG1P05089 322 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 DBHP09172 617 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 COX5BP10606 129 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 RPS27P42677 84 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 FUT6P51993 359 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 GNG3P63215 75 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 KHDC3LQ587J8 217 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 DTX1Q86Y01 620 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 UBTD1Q9HAC8 227 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 G6PC2Q9NQR9 355 aa6.65□□□□□ -1.34
USP54-210ENST00000466048 A8MXK9 166 aa6.65□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 DVL1O14640 695 aa6.65□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 MPZL1O95297 269 aa6.65□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 OR8U8P0C7N1 319 aa6.65□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 FAM157BP0CG42 384 aa6.65□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 P2RY1P47900 373 aa6.65□□□□□ -1.35
USP54-210ENST00000466048 ATP6V1FQ16864 119 aa6.65□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms