RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465245.1

TRA2B-208, Transcript of transformer 2 beta homolog, human

TSL 3

Gene TRA2B, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRA2B-208	ENST00000465245	VCX	Q9H320	206 aa		9.3	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		9.3	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		9.3	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		9.29	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	LINC01619	G3V211	115 aa		9.29	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245		G3V318	75 aa		9.29	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	9.29	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	ATP6V0E1	O15342	81 aa		9.29	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	BAG2	O95816	211 aa		9.29	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	IGLV1-40	P01703	118 aa		9.29	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	ISG15	P05161	165 aa		9.29	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	OR8U9	P0C7N5	309 aa		9.29	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	9.29	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	KCNJ3	P48549	501 aa		9.29	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	RAB9A	P51151	201 aa		9.29	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	PITPNA	Q00169	270 aa		9.29	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	PAX5	Q02548	391 aa		9.29	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	9.29	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		9.29	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		9.29	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	PARP11	Q9NR21	331 aa		9.29	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		9.29	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	9.29	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	IRGM	A1A4Y4	181 aa		9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245		A8MZ25	164 aa		9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	SLC16A6	O15403	523 aa		9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	TXNL1	O43396	289 aa		9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	IFNA6	P05013	189 aa		9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	IL13RA2	Q14627	380 aa		9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	MMD	Q15546	238 aa		9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	KISS1	Q15726	138 aa		9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	TTC23	Q5W5X9	447 aa		9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245		Q8N1Y9	231 aa		9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	SETD9	Q8NE22	299 aa		9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	UBALD1	Q8TB05	177 aa		9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	ARL11	Q969Q4	196 aa		9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	OR4C12	Q96R67	309 aa		9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	9.28	□□□□□ -0.92
TRA2B-208	ENST00000465245	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245		A0A087WW49	117 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	HSPA12A	O43301	675 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	GZMH	P20718	246 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	ZNF85	Q03923	595 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	RAB40B	Q12829	278 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	MED21	Q13503	144 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	GALE	Q14376	348 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	PIGY	Q3MUY2	71 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	ZNF691	Q5VV52	312 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	LPCAT4	Q643R3	524 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	ELP2	Q6IA86	826 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	9.27	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	9.27	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	HERC2	O95714	4834 aa		9.27	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	DAPL1	A0PJW8	107 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	SLC31A2	O15432	143 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	HTR1A	P08908	422 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	ARSB	P15848	533 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	HAGH	Q16775	308 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	ZIK1	Q3SY52	487 aa	Predicted RBP	9.26	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	9.26	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	PXT1	Q8NFP0	134 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	IL17D	Q8TAD2	202 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	STUB1	Q9UNE7	303 aa		9.26	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	KMT2A	Q03164	3969 aa		9.25	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		9.25	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245		A0A1W2PN81	502 aa		9.25	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	C15orf65	H3BRN8	121 aa		9.25	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	SULT1B1	O43704	296 aa		9.25	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	HLA-DRB1	P01911	266 aa		9.25	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	9.25	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	CHRNA7	P36544	502 aa		9.25	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	ZNF137P	P52743	207 aa		9.25	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	LSAMP	Q13449	338 aa		9.25	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	RCN1	Q15293	331 aa		9.25	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	RSU1	Q15404	277 aa		9.25	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	ECSCR	Q19T08	205 aa		9.25	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	FDX2	Q6P4F2	183 aa		9.25	□□□□□ -0.93
TRA2B-208	ENST00000465245	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		9.25	□□□□□ -0.93

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