RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 RDH5Q92781 318 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 IL22RA2Q969J5 263 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 TOMM40LQ969M1 308 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 C5orf30Q96GV9 206 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A32Q9H2D1 315 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 PIGMQ9H3S5 423 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 LUZP4Q9P127 313 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 OR1A1Q9P1Q5 309 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 OR2W1Q9Y3N9 320 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
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PTPRC-210ENST00000462363 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRC-210ENST00000462363 ICE1Q9Y2F5 2266 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
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PTPRC-210ENST00000462363 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRC-210ENST00000462363 C15orf65H3BRN8 121 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 K7EPK0 472 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRC-210ENST00000462363 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
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PTPRC-210ENST00000462363 IGKV1D-39P04432 117 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 HOXB5P09067 269 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRC-210ENST00000462363 FAM27E3Q08E93 113 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
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PTPRC-210ENST00000462363 OR5D13Q8NGL4 314 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRC-210ENST00000462363 PDCD10Q9BUL8 212 aa4.73□□□□□ -1.65
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PTPRC-210ENST00000462363 TRAV39A0A0B4J263 110 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPRC-210ENST00000462363 DPRXA6NFQ7 191 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 FAM25EA8MYX2 175 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 C12orf77C9JDV5 145 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 BET1O15155 118 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 SHOXO15266 292 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 SPDEFO95238 335 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM50AO95807 157 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 TFF1P04155 84 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 GRPP07492 148 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 CD55P08174 381 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRC-210ENST00000462363 PSG2P11465 335 aa4.72□□□□□ -1.65
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