RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
SFRP4-201ENST00000436072 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
SFRP4-201ENST00000436072 H3F3AP84243 136 aa13.21□□□□□ -0.29
SFRP4-201ENST00000436072 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
SFRP4-201ENST00000436072 Q6ZRM9 215 aa13.21□□□□□ -0.29
SFRP4-201ENST00000436072 OR5L2Q8NGL0 311 aa13.21□□□□□ -0.29
SFRP4-201ENST00000436072 GPR146Q96CH1 333 aa13.21□□□□□ -0.29
SFRP4-201ENST00000436072 C2orf88Q9BSF0 95 aa13.21□□□□□ -0.29
SFRP4-201ENST00000436072 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
SFRP4-201ENST00000436072 DKKL1Q9UK85 242 aa13.21□□□□□ -0.29
SFRP4-201ENST00000436072 B4DEV8 164 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 BCL3P20749 454 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 VDAC1P21796 283 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 RND2P52198 227 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 OR5R1Q8NH85 324 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 OR1F12Q8NHA8 337 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 GATAD1Q8WUU5 269 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM54Q969K7 222 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 FUT9Q9Y231 359 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 PSG2P11465 335 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 BMP5P22003 454 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 SPCS3P61009 180 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 SRPXP78539 464 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 PMS2P11Q13670 270 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 PRR18Q8N4B5 295 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 ZIC4Q8N9L1 334 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 GUCD1Q96NT3 240 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 CBLN4Q9NTU7 201 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 RNF115Q9Y4L5 304 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 CCL2P13500 99 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 IL24Q13007 206 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 C10orf128Q5T292 105 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 C9orf135Q5VTT2 229 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 NCR3LG1Q68D85 454 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 WDR5BQ86VZ2 330 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 IL1F10Q8WWZ1 152 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 CDH20Q9HBT6 801 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 CRIM1Q9NZV1 1036 aa13.2□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 FAM186AA6NE01 2351 aa13.19□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa13.19□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 A0A1B0GUS0 222 aa13.19□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 SYNGR3O43761 229 aa13.19□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 OPN1MWP04001 364 aa13.19□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 OPN1MW2P0DN77 364 aa13.19□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 OPN1MW3P0DN78 364 aa13.19□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 CRYGSP22914 178 aa13.19□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 TMEM211Q6ICI0 200 aa13.19□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 SRXN1Q9BYN0 137 aa13.19□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF737O75373 536 aa13.19□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 GNB2P62879 340 aa13.19□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 HIST1H3AP68431 136 aa13.19□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 BAXQ07812 192 aa13.19□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 IGFBP7Q16270 282 aa13.19□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 NDUFAF3Q9BU61 184 aa13.19□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 EXPH5Q8NEV8 1989 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 A0A0J9YW62 118 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 LRRC3CA6NJW4 275 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 DVL1O14640 695 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 SLC23A3Q6PIS1 610 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 DBX2Q6ZNG2 339 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 ZNF488Q96MN9 340 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 PRSS50Q9UI38 385 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 TCFL5Q9UL49 500 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 MKRN2OSH3BPM6 223 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 HS3ST1O14792 307 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 CCL3P10147 92 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 DEFA4P12838 97 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 NR2C1P13056 603 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 CEACAM1P13688 526 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 GALR1P47211 349 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 FUT6P51993 359 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 MLF1P58340 268 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 PSG4Q00888 419 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 SPANXN5Q5MJ07 72 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 OR8G2PQ6IF36 304 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 NEU1Q99519 415 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 CACNG5Q9UF02 275 aa13.18□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 SERPINE2P07093 398 aa13.17□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 CD33P20138 364 aa13.17□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP13.17□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 FAM27BQ5VT28 67 aa13.17□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 DEFB123Q8N688 67 aa13.17□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 OR2V1Q8NHB1 315 aa13.17□□□□□ -0.3
SFRP4-201ENST00000436072 LHX4Q969G2 390 aa13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50 ms