RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427506.5

GPC1-205, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 3

Gene GPC1, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-205ENST00000427506 UBE2QL1A1L167 161 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 CCRL2O00421 344 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 HSD17B6O14756 317 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 MPIG6BO95866 241 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 HSMCR30P0CW71 290 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 TMEM11P17152 192 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 FUT3P21217 361 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 MYF6P23409 242 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 IL3RAP26951 378 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 SLC35A2P78381 396 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 HNF4GQ14541 408 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 HSD17B12Q53GQ0 312 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 C6orf183Q5T699 404 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 MOB3BQ86TA1 216 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 OR4F17Q8NGA8 305 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 UFD1Q92890 307 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 OR4F4Q96R69 305 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 CCDC90BQ9GZT6 254 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 GNG12Q9UBI6 72 aa14.69□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 VWFP04275 2813 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 A0A1W2PRX2 142 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 ERICH4A6NGS2 130 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 C12orf77C9JDV5 145 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 RGS10O43665 173 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 CA11O75493 328 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 IGKV1D-33P01593 117 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 IGKV1-33P01594 117 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 AMY1AP04745 511 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 AMY2AP04746 511 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 UBBP0CG47 229 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 REG1BP48304 166 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 GP2P55259 537 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 LIPKQ5VXJ0 399 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 TRAT1Q6PIZ9 186 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 PHYHIPQ92561 330 aa14.68□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 PDCD6O75340 191 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 HBZP02008 142 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 GLAP06280 429 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 SRMP19623 302 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 LOXL3P58215 753 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 IRF3Q14653 427 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 NKAPLQ5M9Q1 402 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 LRRTM1Q86UE6 522 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 LINC00311Q8N616 119 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 TMEM203Q969S6 136 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 ANKRD60Q9BZ19 345 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 KCNIP1Q9NZI2 227 aa14.67□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 G3V4G9 280 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 CD83Q01151 205 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 TMEM30BQ3MIR4 351 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 Q3ZCU0 254 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 SIGIRRQ6IA17 410 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 OR10K2Q6IF99 312 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 C8orf31Q8N9H6 132 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 OR4X2Q8NGF9 303 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 OR10V1Q8NGI7 309 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 OR1L1Q8NH94 360 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 DUSP21Q9H596 190 aa14.66□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 SC5DO75845 299 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 UCHL1P09936 223 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 VSIG8P0DPA2 414 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 HTR2CP28335 458 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 C1orf100Q5SVJ3 147 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 IZUMO2Q6UXV1 221 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 GAPTQ8N292 157 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 TMEM59Q9BXS4 323 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 TAF9BQ9HBM6 251 aa14.65□□□□□ -0.06
GPC1-205ENST00000427506 SLC31A2O15432 143 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 PF4V1P10720 104 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 CRHBPP24387 322 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 HSPA13P48723 471 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 TRAM1Q15629 374 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 C5orf56Q8N8D9 126 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 KCNG3Q8TAE7 436 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 CNBD2Q96M20 576 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 ISYNA1Q9NPH2 558 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 OR2S2Q9NQN1 319 aa14.64□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 FGF16O43320 207 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 RPS25P62851 125 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 TPBGQ13641 420 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 C10orf99Q6UWK7 81 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14.63□□□□□ -0.07
GPC1-205ENST00000427506 OR6M1Q8NGM8 313 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms