RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PMS1-205ENST00000409985 AVPI1Q5T686 147 aa20.22■□□□□ 0.83
PMS1-205ENST00000409985 Q6P435 159 aa20.22■□□□□ 0.83
PMS1-205ENST00000409985 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa20.22■□□□□ 0.83
PMS1-205ENST00000409985 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa20.22■□□□□ 0.83
PMS1-205ENST00000409985 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
PMS1-205ENST00000409985 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa20.22■□□□□ 0.83
PMS1-205ENST00000409985 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa20.21■□□□□ 0.83
PMS1-205ENST00000409985 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
PMS1-205ENST00000409985 HIKESHIQ53FT3 197 aa20.21■□□□□ 0.83
PMS1-205ENST00000409985 MDP1Q86V88 176 aa20.21■□□□□ 0.83
PMS1-205ENST00000409985 RAB13P51153 203 aa20.2■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 ERVK11-1P61568 191 aa20.2■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa20.2■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 SH3BGRL3Q9H299 93 aa20.2■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 LIPGQ9Y5X9 500 aa20.2■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 COLCA2A8K830 154 aa20.2■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 HSD17B6O14756 317 aa20.2■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 DPPA3Q6W0C5 159 aa20.2■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 C20orf204Q6ZNR8 217 aa20.2■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 RNF115Q9Y4L5 304 aa20.2■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 NFYBP25208 207 aa20.19■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 PPT1P50897 306 aa20.19■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 TGFBR3Q03167 851 aa20.19■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 GABRA6Q16445 453 aa20.19■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 C3AR1Q16581 482 aa20.19■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 OR2T2Q6IF00 324 aa20.19■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 SLC35B3Q9H1N7 401 aa20.19■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 BIN3Q9NQY0 253 aa20.19■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 SSSCA1O60232 199 aa20.18■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 LILRA1O75019 489 aa20.18■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 CA6P23280 308 aa20.18■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 ATP6V0CP27449 155 aa20.18■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 CD200P41217 278 aa20.18■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 RNF212Q495C1 297 aa20.18■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 ZNF766Q5HY98 468 aa20.18■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 OR10V1Q8NGI7 309 aa20.18■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 RAB40CQ96S21 281 aa20.18■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 TPRP12270 2363 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 HS3ST1O14792 307 aa20.18■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 SELEP16581 610 aa20.18■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 ZNF497Q6ZNH5 498 aa20.18■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 OR2G3Q8NGZ4 309 aa20.18■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 RXFP4Q8TDU9 374 aa20.18■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 RDH5Q92781 318 aa20.18■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 C12orf49Q9H741 205 aa20.18■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 SPRR3Q9UBC9 169 aa20.18■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 HSPB6O14558 160 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 RAC2P15153 192 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 ZNF146Q15072 292 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 LINC00518Q8N0U6 118 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 ZNF488Q96MN9 340 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 DEFB127Q9H1M4 99 aa20.17■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 ACACBO00763 2458 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 BSNQ9UPA5 3926 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 ARGFXA6NJG6 315 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 TMEM210A6NLX4 147 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 WRBO00258 174 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 DFFBO76075 338 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 SERPINE2P07093 398 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 RHEBQ15382 184 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 TAAR3PQ9P1P4 343 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 WIPI2Q9Y4P8 454 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 CHST1O43916 411 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 CRYBA1P05813 215 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 ZNF44P15621 663 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 FHITP49789 147 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 C5orf24Q7Z6I8 188 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 ODF3L1Q8IXM7 274 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 OR5C1Q8NGR4 320 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 FAM213BQ8TBF2 198 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 TMEM171Q8WVE6 324 aa20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 CACNA1GO43497 2377 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 SMPD2O60906 423 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 PGA5P0DJD9 388 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 TUBG1P23258 451 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 PAX9P55771 341 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 PPP1CBP62140 327 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 ARG2P78540 354 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 ATP5SQ99766 215 aa20.15■□□□□ 0.82
PMS1-205ENST00000409985 KCNJ16Q9NPI9 418 aa20.15■□□□□ 0.82
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