RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 C12orf77C9JDV5 145 aa12.48□□□□□ -0.41
PGGT1B-202ENST00000379615 C15orf65H3BRN8 121 aa12.48□□□□□ -0.41
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PGGT1B-202ENST00000379615 CLEC2LP0C7M8 214 aa12.48□□□□□ -0.41
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PGGT1B-202ENST00000379615 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
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PGGT1B-202ENST00000379615 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
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PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa12.46□□□□□ -0.41
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PGGT1B-202ENST00000379615 GPR137BO60478 399 aa12.45□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 BRS3P32247 399 aa12.45□□□□□ -0.42
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PGGT1B-202ENST00000379615 MNDAP41218 407 aa12.45□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 ALDH3B2P48448 385 aa12.45□□□□□ -0.42
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PGGT1B-202ENST00000379615 HTD2P86397 168 aa12.45□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 FOXL1Q12952 345 aa12.45□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 PLA2G7Q13093 441 aa12.45□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 MADCAM1Q13477 382 aa12.45□□□□□ -0.42
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PGGT1B-202ENST00000379615 STEAP3Q658P3 488 aa12.45□□□□□ -0.42
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR1L1Q8NH94 360 aa12.45□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 LGALS14Q8TCE9 139 aa12.45□□□□□ -0.42
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PGGT1B-202ENST00000379615 JPT1Q9UK76 154 aa12.45□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 PITPNC1Q9UKF7 332 aa12.45□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM89A2RUT3 159 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV3-7P01780 117 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 TFAP2AP05549 437 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 HKR1P10072 659 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
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PGGT1B-202ENST00000379615 TALDO1P37837 337 aa12.44□□□□□ -0.42
PGGT1B-202ENST00000379615 SERPINB10P48595 397 aa12.44□□□□□ -0.42
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