RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 IL2RAP01589 272 aa4.32□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 IL9P15248 144 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 GNB3P16520 340 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 AVPR2P30518 371 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 GAGE1Q13065 139 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 SQSTM1Q13501 440 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 TTC32Q5I0X7 151 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 ZNF506Q5JVG8 444 aa4.32□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 SPSB4Q96A44 273 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 NUDT11Q96G61 164 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 TEX37Q96LM6 180 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 SLC7A10Q9NS82 523 aa4.32□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 A0A1B0GTH9 108 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 H0Y8X5 98 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 PLPP3O14495 311 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 SP9P0CG40 484 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 POU2AF1Q16633 256 aa4.32□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 ZNF740Q8NDX6 193 aa4.32□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 SEC22AQ96IW7 307 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 GAGE10A6NGK3 116 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 J3KTA2 159 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 UPK1AO00322 258 aa4.32□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 WNT3P56703 355 aa4.32□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 TMEM99Q8N816 258 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 FADS6Q8N9I5 356 aa4.32□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 MGST2Q99735 147 aa4.32□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa4.32□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 PHLDA2Q53GA4 152 aa4.32□□□□□ -1.72
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PTPRD-201ENST00000355233 OR4D5Q8NGN0 318 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 SLC37A2Q8TED4 501 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 UBE2FQ969M7 185 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRD-201ENST00000355233 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
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