RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 CLDN34H7C241 214 aa14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB29O14966 203 aa14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PDZD11Q5EBL8 140 aa14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 VAX1Q5SQQ9 334 aa14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 APCDD1LQ8NCL9 501 aa14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PRR13Q9NZ81 148 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 CKAP5Q14008 2032 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC31A2O15432 143 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PRF1P14222 555 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 SULT1A1P50225 295 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 DYRK2Q92630 601 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PKIBQ9C010 78 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 MYOFQ9NZM1 2061 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 K7N7A8 449 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 SEMA7AO75326 666 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 CEACAM1P13688 526 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 MMDQ15546 238 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 C1orf100Q5SVJ3 147 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 GCSAMQ8N6F7 178 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 OR10A7Q8NGE5 316 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 BLNKQ8WV28 456 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF714Q96N38 554 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 GP6Q9HCN6 339 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 HSBP1O75506 76 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 HPXP02790 462 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ADRA2AP08913 450 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ZP3P21754 424 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 C4orf17Q53FE4 359 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 LYZL2Q7Z4W2 148 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 SHISA5Q8N114 240 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 OR8G5Q8NG78 346 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 OR5R1Q8NH85 324 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ITLN1Q8WWA0 313 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM122AQ96E09 287 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PRR19A6NJB7 356 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 NDUFA2O43678 99 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PRDM14Q9GZV8 571 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 LPAR5Q9H1C0 372 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 SPTBP11277 2137 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 NPY1RP25929 384 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 FBLIM1Q8WUP2 373 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ST6GAL2Q96JF0 529 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 CCL13Q99616 98 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 NKX2-6A6NCS4 301 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 MPV17P39210 176 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 PDPNQ86YL7 162 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 COX6B1P14854 86 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 DAOP14920 347 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 OR1B1Q8NGR6 318 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 Q8WTZ3 238 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-201ENST00000344528 LOC285556D6RIA3 1793 aa14.15□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB5AP20339 215 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF788Q6ZQV5 615 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 SRXN1Q9BYN0 137 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 MANBALQ9NQG1 85 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 KLK13Q9UKR3 277 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 J3QW42 95 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 IGHMP01871 453 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 CXCL3P19876 107 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 G6PCP35575 357 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 PCGF1Q9BSM1 259 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 FDCSPQ8NFU4 85 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 SNX22Q96L94 193 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNK7Q9Y2U2 307 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 GATCO43716 136 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 PSG2P11465 335 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF154Q13106 437 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 SCMH1Q96GD3 660 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 NIT2Q9NQR4 276 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 HPRT1P00492 218 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 HOXA6P31267 233 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 C10orf128Q5T292 105 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 LPAR2Q9HBW0 351 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM206AQ9NX38 181 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF115Q9Y4L5 304 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 J3QR06 171 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 FA2HQ7L5A8 372 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 TIMP4Q99727 224 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM208Q9BTX3 173 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM229AB2RXF0 380 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 RGS13O14921 159 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2H2O95918 312 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-201ENST00000344528 GYPAP02724 150 aa14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.4 ms