RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 SPRNQ5BIV9 151 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 CLEC18BQ6UXF7 455 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 KCTD9Q7L273 389 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 CMTM1Q8IZ96 169 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 MUC15Q8N387 334 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF561Q8N587 486 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 CD177Q8N6Q3 437 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 ANGPTL6Q8NI99 470 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 CHIAQ9BZP6 476 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 SHARPINQ9H0F6 387 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 LIME1Q9H400 295 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 OPN4Q9UHM6 478 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 KIF25Q9UIL4 384 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 CACNA1BQ00975 2339 aa8.46□□□□□ -1.05
RABGGTB-201ENST00000319942 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.46□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFB108AA8MXU0 73 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 B8ZZF3 427 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 K7N7A8 449 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF737O75373 536 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 TUSC2O75896 110 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 HEXAP06865 529 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 IL2RGP31785 369 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 OR3A1P47881 315 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 UQCRFS1P47985 274 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNJ8Q15842 424 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 MST1LQ2TV78 715 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 TEX36Q5VZQ5 186 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6ZPA2 131 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 PRR18Q8N4B5 295 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFB108BQ8NET1 73 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 CCL17Q92583 94 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 NEUROG1Q92886 237 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 NINJ1Q92982 152 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM230Q96A57 120 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 SDSLQ96GA7 329 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM204Q9BSN7 226 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 PDCD10Q9BUL8 212 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 RSRP1Q9BUV0 290 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC5A7Q9GZV3 580 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM234AQ9H0X4 552 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF665Q9H7R5 613 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 ICE1Q9Y2F5 2266 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 PKD1L2Q7Z442 2459 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 PPIAL4EA0A075B759 164 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 PPIAL4DF5H284 164 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 LGALS8O00214 317 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 GPR31O00270 319 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF205O95201 554 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 SIX6O95475 246 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 PLAUP00749 431 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 IFNA21P01568 189 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 PPIAL4FP0DN26 164 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 C4BPBP20851 252 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 CEACAM6P40199 344 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 GLIPR1P48060 266 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 LUMP51884 338 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 FGL1Q08830 312 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 HERPUD1Q15011 391 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC9A3R2Q15599 337 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 HMGN3Q15651 99 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 GSG1LQ6UXU4 331 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 SECTM1Q8WVN6 248 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 GALNT14Q96FL9 552 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 SUCNR1Q9BXA5 334 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 DNTTIP1Q9H147 329 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB18Q9NP72 206 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 OR6C3Q9NZP0 311 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 COMMD9Q9P000 198 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 PPIAL4AQ9Y536 164 aa8.45□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 ROS1P08922 2347 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 PLCE1Q9P212 2302 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV39A0A0B4J263 110 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 ODAMA1E959 279 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 C5orf51A6NDU8 294 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM25EA8MYX2 175 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 SMLR1H3BR10 107 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM178BH3BS89 294 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 MPPED1O15442 326 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFA2O43678 99 aa8.44□□□□□ -1.06
RABGGTB-201ENST00000319942 GNRHRP30968 328 aa8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms