RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 TXNL1O43396 289 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXB3-201ENST00000311626 FABP9Q0Z7S8 132 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXB3-201ENST00000311626 HNF4GQ14541 408 aa21.54■■□□□ 1.04
HOXB3-201ENST00000311626 NBEAQ8NFP9 2946 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXB3-201ENST00000311626 H0Y980 276 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXB3-201ENST00000311626 LINC01387J3KSC0 135 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXB3-201ENST00000311626 DEGS1O15121 323 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXB3-201ENST00000311626 HSPA12AO43301 675 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXB3-201ENST00000311626 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
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HOXB3-201ENST00000311626 SERPINE2P07093 398 aa21.53■■□□□ 1.04
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HOXB3-201ENST00000311626 RPS23P62266 143 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
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HOXB3-201ENST00000311626 GTF3C1Q12789 2109 aa21.53■■□□□ 1.04
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HOXB3-201ENST00000311626 OR1J1Q8NGS3 322 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXB3-201ENST00000311626 MMP24Q9Y5R2 645 aa21.53■■□□□ 1.04
HOXB3-201ENST00000311626 DSPP15924 2871 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HOXB3-201ENST00000311626 PRR14LQ5THK1 2151 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXB3-201ENST00000311626 IGKV1-39P01597 117 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXB3-201ENST00000311626 IGKV1D-39P04432 117 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXB3-201ENST00000311626 IFNA4P05014 189 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXB3-201ENST00000311626 MPLP40238 635 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXB3-201ENST00000311626 GNG3P63215 75 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXB3-201ENST00000311626 CLN3Q13286 438 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXB3-201ENST00000311626 ALKBH6Q3KRA9 238 aa21.52■■□□□ 1.04
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HOXB3-201ENST00000311626 HLA-DRB3P79483 266 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXB3-201ENST00000311626 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXB3-201ENST00000311626 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa21.52■■□□□ 1.04
HOXB3-201ENST00000311626 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 H3BQ15 152 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 OR2C1O95371 312 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 COX5BP10606 129 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 SLC25A24Q6NUK1 477 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF343Q6P1L6 599 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 WDR86Q86TI4 376 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 LFNGQ8NES3 379 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 KCNS2Q9ULS6 477 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF573Q86YE8 665 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 VSIRQ9H7M9 311 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 CACNG5Q9UF02 275 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa21.51■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 LNP1A1A4G5 178 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 CLEC18AA5D8T8 446 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 CTXN2P0C2S0 81 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
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HOXB3-201ENST00000311626 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
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HOXB3-201ENST00000311626 OR1K1Q8NGR3 316 aa21.5■■□□□ 1.03
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HOXB3-201ENST00000311626 OR51I2Q9H344 312 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 IGLV2-14P01704 120 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 SRP19P09132 144 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 RNF212Q495C1 297 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 ATP5SQ99766 215 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 KMT2EQ8IZD2 1858 aa21.5■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF806P0C7X5 589 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 ARL16Q0P5N6 197 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 RHEBQ15382 184 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 OR10V1Q8NGI7 309 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 ABI3Q9P2A4 366 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 TFF1P04155 84 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 METTL15P1P0C7V9 234 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 RNFT1Q5M7Z0 435 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 ZPBPQ9BS86 351 aa21.49■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 WDR1O75083 606 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 Q6P435 159 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 TUBA4BQ9H853 241 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 SP1P08047 785 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 TESK1Q15569 626 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 POM121Q96HA1 1249 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 DDA1Q9BW61 102 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 CACNA1DQ01668 2161 aa21.48■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
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HOXB3-201ENST00000311626 OR2J1Q9GZK6 312 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 CDIPTO14735 213 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 OR2H2O95918 312 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 NCMAPQ5T1S8 102 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 RNF150Q9ULK6 438 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 MPC1Q9Y5U8 109 aa21.47■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 IGKV1-5P01602 117 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 RPS10P46783 165 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 UBE2KP61086 200 aa21.46■■□□□ 1.03
HOXB3-201ENST00000311626 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
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