RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF814B7Z6K7 855 aa12.7□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 KIR2DS3K7RE56 304 aa12.7□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 WDR1O75083 606 aa12.7□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGHV3-9P01782 118 aa12.7□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 TCN2P20062 427 aa12.7□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 KIR2DS5Q14953 304 aa12.7□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 DCAF10Q5QP82 559 aa12.7□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 SGMS2Q8NHU3 365 aa12.7□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 CDH20Q9HBT6 801 aa12.7□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 FBLN5Q9UBX5 448 aa12.7□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 M0QZK8 103 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 GGCTO75223 188 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 CLPSP04118 112 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 SRPXP78539 464 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 IL24Q13007 206 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM183BQ1AE95 376 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPTSSAQ969W0 71 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 ACY3Q96HD9 319 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A1B0GW64 132 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 LIPT2A6NK58 231 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 B4E171 279 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCL5P13501 91 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 VDAC1P21796 283 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 DTYMKP23919 212 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 TSPAN7P41732 249 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 PPP1CBP62140 327 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 SLC35B1P78383 322 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 DTX1Q86Y01 620 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 A6NCN8 305 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF732B4DXR9 585 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 NRASP01111 189 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 PARM1Q6UWI2 310 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 ASCL3Q9NQ33 180 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 SELENOKQ9Y6D0 94 aa12.69□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 SIRPB1O00241 398 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 TM4SF4P48230 202 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 RND2P52198 227 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF90Q03938 601 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM170AQ8WVE7 144 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 PP6455Q8WZ26 134 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 MOB3AQ96BX8 217 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 ULBP2Q9BZM5 246 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 ALKBH4Q9NXW9 302 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 NUP210LQ5VU65 1888 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 TUSC2O75896 110 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 PFN1P07737 140 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 PSG2P11465 335 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 MSR1P21757 451 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 CBLN1P23435 193 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 OTX2P32243 289 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 HBG1P69891 147 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 HBG2P69892 147 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 SHHQ15465 462 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 RAET1LQ5VY80 246 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 OR2V1Q8NHB1 315 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 OR4C12Q96R67 309 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 TSPAN2O60636 221 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 CA3P07451 260 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGKV1-13P0DP09 117 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 NPBWR2P48146 333 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 KIAA1644Q3SXP7 199 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF573Q86YE8 665 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 OR1L6Q8NGR2 347 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 FGF14Q92915 247 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 OR6C3Q9NZP0 311 aa12.68□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa12.67□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 TP53I11O14683 189 aa12.67□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 CDKN1AP38936 164 aa12.67□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 VAMP3Q15836 100 aa12.67□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 GBGT1Q8N5D6 347 aa12.67□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF318Q5VUA4 2279 aa12.67□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 KITLGP21583 273 aa12.67□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 BRS3P32247 399 aa12.67□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 MPLP40238 635 aa12.67□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 TPPP2P59282 170 aa12.67□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF726P1Q15940 193 aa12.67□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP12.67□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM131CQ96AQ9 280 aa12.67□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 MRGPRX1Q96LB2 322 aa12.67□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 ANAPC10Q9UM13 185 aa12.67□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRR19A6NJB7 356 aa12.67□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 IL3RAP26951 378 aa12.67□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa12.67□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 WNT10AQ9GZT5 417 aa12.67□□□□□ -0.38
CCNDBP1-201ENST00000300213 R4GN57 208 aa12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.4 ms