RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 PAPPAQ13219 1627 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 LINC00862A6NCI5 91 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM250H0YL14 139 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 IGHEP01854 428 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 ID1P41134 155 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEFF1Q8IYR6 380 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 OR1N1Q8NGS0 311 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 RLN3Q8WXF3 142 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 TANC1Q9C0D5 1861 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 TCRBV5S2A0A599 114 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 TGFAP01135 160 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 MMP16P51512 607 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 NPIPB8E9PQR5 432 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 NPIPB9F8W1W9 429 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 NPIPB7O75200 414 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 SBK3P0C264 359 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 TRGC1P0CF51 173 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 ATOH7Q8N100 152 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 SSMEM1Q8WWF3 244 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 LDLRAD4O15165 306 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 NKX2-8O15522 239 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 PITX3O75364 302 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 CHODLQ9H9P2 273 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM189A5PLL7 270 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 NKAIN2Q5VXU1 208 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 C1SP09871 688 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 RAG2P55895 527 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 TCF24Q7RTU0 167 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 LINC00518Q8N0U6 118 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 DPRXA6NFQ7 191 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 GUCA2AQ02747 115 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 PAX2Q02962 417 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 MED25Q71SY5 747 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 NTMQ9P121 344 aa9.92□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 COL18A1P39060 1754 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 MAS1LP35410 378 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 MPLP40238 635 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 OR10D3Q8NH80 312 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 TPSD1Q9BZJ3 242 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 CYSLTR2Q9NS75 346 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 TAAR3PQ9P1P4 343 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 M0R1B8 84 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 GLRX2Q9NS18 164 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 PRDX2P32119 198 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 ERV3-1Q14264 604 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 CA6P23280 308 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 SH2D5Q6ZV89 423 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 OR10V1Q8NGI7 309 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 ARRDC5A6NEK1 342 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 CA13Q8N1Q1 262 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 PLAURQ03405 335 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 DCAF12Q5T6F0 453 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 C1orf185Q5T7R7 199 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 IGHV3-9P01782 118 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 RAC3P60763 192 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 RHBDD1Q8TEB9 315 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 LTBP3Q9NS15 1303 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 PMELP40967 661 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 RIMKLAQ8IXN7 391 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 BADQ92934 168 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.91□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 FUT3P21217 361 aa9.9□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 Q96M85 177 aa9.9□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 H0YGG7 62 aa9.9□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 SFT2D2O95562 160 aa9.9□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 PPIAP62937 165 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 RUNX3Q13761 415 aa9.9□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 PRSS54Q6PEW0 395 aa9.9□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 ORAI1Q96D31 301 aa9.9□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 S1PR5Q9H228 398 aa9.9□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 CHST1O43916 411 aa9.9□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 C10orf113Q5VZT2 155 aa9.9□□□□□ -0.82
HDGFL3-201ENST00000299633 OR52N5Q8NH56 324 aa9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms