RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.03□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.03□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 GNG12Q9UBI6 72 aa6.03□□□□□ -1.44
PGGT1B-201ENST00000296642 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 METTL15A6NJ78 407 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 ORC5O43913 435 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 AIREO43918 545 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 TFAP2AP05549 437 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 SSTR5P35346 364 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF137PP52743 207 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTBP60709 375 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 PMS2P11Q13670 270 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTBL2Q562R1 376 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 CNIH3Q8TBE1 160 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 RFT1Q96AA3 541 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 SPACA5Q96QH8 159 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 S100A13Q99584 98 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 RETNQ9HD89 108 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.02□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 LANCL1O43813 399 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 CST1P01037 141 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV3-11P01762 117 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 MT-ND2P03891 347 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 TRGV3P03979 118 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 OR2T7P0C7T2 308 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 RAP2AP10114 183 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 AADACP22760 399 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP2K4P45985 399 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 LSAMPQ13449 338 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 RSU1Q15404 277 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 C6orf183Q5T699 404 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 NXNL2Q5VZ03 156 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 ELP2Q6IA86 826 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5D18Q8NGL1 313 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 NEK7Q8TDX7 302 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 FGGYQ96C11 551 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 GPER1Q99527 375 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 NEURL2Q9BR09 285 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD60Q9BZ19 345 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 ARL8BQ9NVJ2 186 aa6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A0B4J203 849 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC182A6NF36 153 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BUA1 57 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV1D-12P01611 117 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 MED14OSP0DP75 135 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP6V1B2P21281 511 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 CDK5R1Q15078 307 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 RPEL1Q2QD12 228 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 C4orf48Q5BLP8 95 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 UTF1Q5T230 341 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC00596Q86U02 117 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 PPP1R27Q86WC6 154 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 DHFR2Q86XF0 187 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP24Q8N264 748 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 PXT1Q8NFP0 134 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 OR13C3Q8NGS6 347 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 OR13C9Q8NGT0 318 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 RHOVQ96L33 236 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 JAM3Q9BX67 310 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 SPACA1Q9HBV2 294 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 ADGRL4Q9HBW9 690 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 ENOPH1Q9UHY7 261 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 A3GALT2U3KPV4 340 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 TNCP24821 2201 aa6□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 TRAV24A0A0B4J272 114 aa5.99□□□□□ -1.45
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa5.99□□□□□ -1.45
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