RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255304.8

USPL1-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USPL1, Length 3,814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1-201ENST00000255304 TMEM33P57088 247 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 HIST1H2BDP58876 126 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 ERVK-16P61578 105 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 HIST1H2BCP62807 126 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 PSG4Q00888 419 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 BAXQ07812 192 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 OR5I1Q13606 314 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 UBE2V2Q15819 145 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 MAJINQ3KP22 176 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 Q8WTZ3 238 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 LIPGQ9Y5X9 500 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 A0A1W2PQD3 144 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 C5orf63A6NC05 138 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 ZNF724A8MTY0 619 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 J3QRE1 110 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 K7ESF4 209 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 MFNGO00587 321 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 PCOLCEQ15113 449 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 TMEM128Q5BJH2 165 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 OR2M7Q8NG81 312 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 OR1K1Q8NGR3 316 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 PP6455Q8WZ26 134 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 ATP23Q9Y6H3 246 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 SNAPC5O75971 98 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 TFF1P04155 84 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 FUT3P21217 361 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 NPBWR2P48146 333 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 MMP16P51512 607 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 UCP3P55916 312 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 RAB11AP62491 216 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 COTL1Q14019 142 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 CLEC18BQ6UXF7 455 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 CCL17Q92583 94 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 NTNG2Q96CW9 530 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 RAB39BQ96DA2 213 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 KCNK17Q96T54 332 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 TTTY12Q9BZ98 90 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 CYTL1Q9NRR1 136 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 GNG13Q9P2W3 67 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 PROCRQ9UNN8 238 aa6.6□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 TOX4O94842 621 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 COX6A1P12074 109 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 BCL3P20749 454 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 GALP22466 123 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 PAX6P26367 422 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 CD200P41217 278 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 DLK1P80370 383 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 PMS2P11Q13670 270 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 RAB35Q15286 201 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 WDR5BQ86VZ2 330 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 KCNE4Q8WWG9 221 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 ERGIC1Q969X5 290 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 SARAFQ96BY9 339 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 GPR35Q9HC97 309 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 AK3Q9UIJ7 227 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 NAV3Q8IVL0 2385 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 H3BQ15 152 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 FGF16O43320 207 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 SNCAP37840 140 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 ERVS71-1P61550 626 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 NHLH2Q02577 135 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 HGFACQ04756 655 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 LYZL2Q7Z4W2 148 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 RTL8AQ9BWD3 113 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 TACC2O95359 2948 aa6.59□□□□□ -1.35
USPL1-201ENST00000255304 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa6.59□□□□□ -1.36
USPL1-201ENST00000255304 PRRG2O14669 202 aa6.59□□□□□ -1.36
USPL1-201ENST00000255304 EFNA2O43921 213 aa6.59□□□□□ -1.36
USPL1-201ENST00000255304 OR4A8P0C604 315 aa6.59□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms