RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221770.7

POP4-201, Transcript of POP4 homolog, ribonuclease P/MRP subunit, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POP4, Length 2,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4-201ENST00000221770 GNMTQ14749 295 aa13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 LINC00596Q86U02 117 aa13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 TBC1D26Q86UD7 250 aa13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 ZNF573Q86YE8 665 aa13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 SECTM1Q8WVN6 248 aa13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 C12orf49Q9H741 205 aa13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 SPACA1Q9HBV2 294 aa13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 CDS2O95674 445 aa13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 IFNA17P01571 189 aa13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 SFTA3P0C7M3 94 aa13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 SEC11BP0C7V7 166 aa13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 Q6ZRG5 221 aa13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 ZNF695Q8IW36 515 aa13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 IL22RA1Q8N6P7 574 aa13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 OR1K1Q8NGR3 316 aa13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 TMEM56Q96MV1 263 aa13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 DEFB127Q9H1M4 99 aa13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 WFDC1Q9HC57 220 aa13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 IL36RNQ9UBH0 155 aa13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 ATP23Q9Y6H3 246 aa13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa13.41□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 DMDP11532 3685 aa13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 OR5B21A6NL26 309 aa13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 WNT5AP41221 380 aa13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 GNG3P63215 75 aa13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 HIKESHIQ53FT3 197 aa13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 HES3Q5TGS1 186 aa13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 C5orf24Q7Z6I8 188 aa13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 GINS3Q9BRX5 216 aa13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 GLRX2Q9NS18 164 aa13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 LIPGQ9Y5X9 500 aa13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 KMT2EQ8IZD2 1858 aa13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 NKX2-6A6NCS4 301 aa13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 TMEM210A6NLX4 147 aa13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 HSPB6O14558 160 aa13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 CD5P06127 495 aa13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 NDUFA6P56556 154 aa13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 HNF4GQ14541 408 aa13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 FBXW9Q5XUX1 488 aa13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 SUMF2Q8NBJ7 301 aa13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 LYPD6BQ8NI32 183 aa13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 WDYHV1Q96HA8 205 aa13.4□□□□□ -0.26
POP4-201ENST00000221770 SLC22A20A6NK97 555 aa13.39□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 TUSC2O75896 110 aa13.39□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 IL18BPO95998 194 aa13.39□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 HERPUD1Q15011 391 aa13.39□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa13.39□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 GAPTQ8N292 157 aa13.39□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 FAM24BQ8N5W8 94 aa13.39□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 SPIN2AQ99865 258 aa13.39□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa13.39□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 SNHG12Q9BXW3 62 aa13.39□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 CACFD1Q9UGQ2 172 aa13.39□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa13.39□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 AGPAT2O15120 278 aa13.39□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 RBX1P62877 108 aa13.39□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 IL24Q13007 206 aa13.39□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 DOK5Q9P104 306 aa13.39□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 A8MXE2 369 aa13.38□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 SEC14L6B5MCN3 397 aa13.38□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 LILRA1O75019 489 aa13.38□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 DANCRP0C864 163 aa13.38□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 FAM58AQ8N1B3 248 aa13.38□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 ZNF488Q96MN9 340 aa13.38□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 PKIBQ9C010 78 aa13.38□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa13.38□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa13.38□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 HSD17B6O14756 317 aa13.38□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 HS3ST1O14792 307 aa13.38□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 TSPAN15O95858 294 aa13.38□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 CD80P33681 288 aa13.38□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 ID4P47928 161 aa13.38□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 ZNF766Q5HY98 468 aa13.38□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.38□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 OR2T2Q6IF00 324 aa13.38□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 MDP1Q86V88 176 aa13.38□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 CMTM1Q8IZ96 169 aa13.38□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 GP6Q9HCN6 339 aa13.38□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 CCL28Q9NRJ3 127 aa13.38□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 LUZP4Q9P127 313 aa13.38□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa13.37□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa13.37□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 C7orf77A4D0Y5 90 aa13.37□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 OR8U9P0C7N5 309 aa13.37□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 IGKV1-13P0DP09 117 aa13.37□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 CA6P23280 308 aa13.37□□□□□ -0.27
POP4-201ENST00000221770 ARG2P78540 354 aa13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms