RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	PTPRB	P23467	1997 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SPTBN2	O15020	2390 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1B0GU03	582 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	MEIOC	A2RUB1	952 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SULT1C2	O00338	296 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	PLPP3	O14495	311 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CHST10	O43529	356 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	FGF17	O60258	216 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2B3	O76000	313 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	HMGN1	P05114	100 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	KLK3	P07288	261 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	IFI6	P09912	130 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	PET100	P0DJ07	73 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CT45A6	P0DMU7	189 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CT45A5	P0DMU8	189 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CT45A10	P0DMU9	189 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CT45A7	P0DMV0	189 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	TBP	P20226	339 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB4A	P20338	218 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	GABRA3	P34903	492 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	OMP	P47874	163 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB38	P57729	211 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SRPX	P78539	464 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	HOXC5	Q00444	222 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	C1D	Q13901	141 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CA13	Q8N1Q1	262 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	FTMT	Q8N4E7	242 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	COX18	Q8N8Q8	333 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF524	Q96C55	264 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5M11	Q96RB7	305 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	STAC	Q99469	402 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF126	Q9BV68	326 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	MND1	Q9BWT6	205 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	POLR2J2	Q9GZM3	115 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	OR51E2	Q9H255	320 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	OR51J1	Q9H342	316 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	FAIM	Q9NVQ4	179 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC39A1	Q9NY26	324 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	PRODH2	Q9UF12	536 aa		3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		3.9	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SPTB	P11277	2137 aa		3.9	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ATM	Q13315	3056 aa		3.9	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1B0GX78	115 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	METTL15	A6NJ78	407 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	EFCAB7	A8K855	629 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	MYL12B	O14950	172 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	HCRTR1	O43613	425 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CTNS	O60931	367 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SULT1C4	O75897	302 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB36	O95755	333 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OCM2	P0CE71	109 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CCL4	P13236	92 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	MYL12A	P19105	171 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	TGM4	P49221	684 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	DLX5	P56178	289 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2B8P	P59922	312 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF45	Q02386	682 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	STX4	Q12846	297 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF146	Q15072	292 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	MAPK14	Q16539	360 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		3.9	□□□□□ -1.79
EFHC1-223	ENST00000636616	WDR82	Q6UXN9	313 aa		3.9	□□□□□ -1.79

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